Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  277  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91971336--91971389
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0
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2.0
40
100
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91979403--91979520
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2.1
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1.8
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46
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10
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29
28
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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92014404--92014440
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11
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111
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334
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18
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21
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1
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32
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2
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1.64
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2
13
47
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92050789--92051040
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2
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47
1.57
92050789--92051029
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44
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254
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2
13
47
1.58
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0
1
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1.08
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2.9
29
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53
0
1
45
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24
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0
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20
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19
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3.0
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11
2
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77
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92109890--92109919
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0
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0
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2.6
15
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51
61
0
5
33
1.18
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25
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18
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0
0
55
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70
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0
0
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0
0
44
0.99
92129387--92129475
34
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34
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0
0
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2
34
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35
1.20
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0
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41
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18
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13
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50
0
5
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1.23
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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0
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2.2
22
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18
0
75
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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144
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2.0
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30
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107
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234
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0
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57
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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