Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  288  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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25
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2
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3.7
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1
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44
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14
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3
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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Entropy
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2.5
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5
57
64
1
3
30
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95382988--95383095
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26
19
27
27
1.99
95420682--95420940
46
5.6
46
90
0
367
42
12
23
21
1.87
95420694--95420952
138
1.9
138
89
3
405
42
13
23
20
1.88
95421237--95421269
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
95424016--95424081
6
11.2
6
98
1
125
16
0
0
83
0.65
95430394--95430442
25
2.0
25
83
0
62
34
12
18
34
1.88
95436725--95436765
13
3.2
13
96
0
73
14
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34
17
1.90
95443866--95443906
20
2.0
20
85
0
55
34
21
14
29
1.93
95446985--95447110
33
3.8
33
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0
135
41
14
23
20
1.89
95446985--95447110
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1.9
66
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0
153
41
14
23
20
1.89
95447033--95447125
33
2.8
33
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100
46
11
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19
1.82
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7
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1.60
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3
12.7
3
88
0
58
28
0
5
65
1.14
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0
0
59
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2.0
37
100
0
150
37
10
18
33
1.86
95465930--95465967
17
2.2
18
86
13
53
39
15
7
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95465939--95465984
17
2.7
17
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12
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39
15
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39
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95465956--95466009
25
2.1
26
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3
92
38
12
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40
1.72
95465966--95466021
25
2.2
25
90
6
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37
12
7
42
1.70
95466186--95466242
29
2.0
29
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0
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21
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2.0
94
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0
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4
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1.72
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201
2.0
201
96
0
757
29
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1.78
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0
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1.74
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19
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1.68
95492131--95492192
19
3.3
19
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1.77
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2.5
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1.89
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10
3.5
10
100
0
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31
1.69
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4.0
26
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0
174
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2.0
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25
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2.1
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70
0
0
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0.87
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19
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50
1.10
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34
1.81
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2.5
57
88
2
203
36
2
20
39
1.67
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22
3.7
24
78
17
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46
1
1
51
1.15
95540144--95540231
23
3.7
25
78
15
73
46
1
1
51
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95543344--95543378
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5.8
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0
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0
0.72
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100
0
60
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0
10
50
1.36
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51
2.0
51
100
0
206
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21
21
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21
2.6
21
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0
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30
9
30
29
1.88
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4.1
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22
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2
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28
2
0
69
1.02
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20
2.3
19
81
14
56
28
2
2
66
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343