Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  197  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65279853--65279877
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2.0
27
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38
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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16
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27
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0
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2.3
93
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23
29
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1.91
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5.1
41
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5
203
41
19
19
19
1.91
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20
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0
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
3.0
22
76
6
55
62
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1
33
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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21
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61
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2.3
21
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34
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19
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1.47
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26
3.0
29
77
17
99
60
3
4
31
1.34
65415312--65415452
13
10.9
13
69
19
66
56
2
5
34
1.37
65415390--65415452
24
2.6
24
83
11
76
52
4
4
38
1.44
65415503--65415567
21
3.2
20
81
10
80
58
4
1
35
1.28
65415550--65415616
3
22.0
3
73
14
57
62
0
2
34
1.10
65429689--65429738
14
3.6
14
100
0
100
46
12
16
26
1.81
65431950--65432113
3
54.7
3
67
18
74
31
6
2
59
1.36
65431952--65431997
23
2.0
23
83
8
58
28
6
0
65
1.17
65432346--65432459
21
5.3
20
81
8
95
34
3
3
58
1.32
65432330--65432384
19
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16
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16
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38
1
0
60
1.08
65432346--65432463
20
5.3
21
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34
3
3
58
1.31
65432541--65432696
25
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24
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33
8
5
52
1.55
65440984--65441044
20
3.0
20
87
4
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45
27
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14
1.80
65440995--65441044
20
2.5
20
93
0
82
48
26
12
14
1.78
65444113--65444483
144
2.5
146
80
7
412
29
16
19
34
1.94
65444113--65444574
75
6.3
73
79
9
413
29
16
19
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65446013--65446060
20
2.2
21
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14
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4
41
0
54
1.20
65446487--65446650
3
54.7
3
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18
74
31
6
2
59
1.37
65446489--65446534
23
2.0
23
83
8
58
28
6
0
65
1.17
65446611--65446661
24
2.1
24
82
13
61
31
1
7
58
1.37
65446652--65446682
16
1.9
16
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0
53
32
0
12
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1.38
65446885--65447001
23
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2
4
60
1.29
65446884--65446995
45
2.5
45
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133
32
2
4
60
1.30
65446999--65447033
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2.1
17
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25
0
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1.48
65449856--65449925
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2.6
27
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2
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1.58
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27
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1
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34
1.36
65452029--65452171
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2.1
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31
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1.68
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4.2
26
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0
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1.86
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137
3.1
137
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0
803
25
18
24
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1.98
65459672--65459709
3
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3
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0
67
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2
0
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1.09
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2
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1.53
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2.1
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1.63
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17
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43
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10
29
1.81
65464430--65464486
27
2.1
27
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0
105
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1.98
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23
3.6
23
76
15
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0
42
0
0.98
65470927--65470967
10
3.7
11
87
9
57
65
0
34
0
0.93
65470921--65470977
22
3.0
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24
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64
0
35
0
0.93
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22
2.1
23
88
11
73
52
4
4
39
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65483404--65483565
9
15.9
9
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54
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1
4
57
1.26
65483405--65483487
23
3.6
23
68
17
64
37
1
2
59
1.19
65483407--65483565
20
7.7
20
68
22
89
36
1
4
57
1.27
65484579--65484604
3
8.7
3
100
0
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30
0
0
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2.3
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0
331
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41
1.77
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100
0
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0
0
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0.90
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0
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1.76
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53
100
0
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221
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2
1149
32
19
19
29
1.96
65497117--65497149
16
2.0
17
88
5
50
24
9
0
66
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343