Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20945839--20946118
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124
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0
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19
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0
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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19
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2.2
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59
11
26
26
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2.0
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17
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29
8
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1.87
21134824--21135432
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91
3
941
29
29
8
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1.87
21134824--21135432
239
2.6
240
93
2
1023
29
29
8
32
1.87
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3.7
25
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35
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21144167--21144318
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5.6
27
93
3
241
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28
13
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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12
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0
0
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11
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0
0
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21161985--21162020
16
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0
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1.99
21177116--21177338
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21
27
26
1.99
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20
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0
35
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
21220453--21220493
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15
1.9
16
93
6
53
56
0
0
43
0.99
21252352--21252419
34
2.0
34
100
0
136
47
2
14
35
1.60
21258213--21258250
20
2.1
19
85
14
53
23
26
10
39
1.87
21269736--21269868
47
2.9
45
82
11
162
29
18
30
22
1.97
21269736--21269956
94
2.3
93
83
6
268
28
16
29
24
1.97
21271023--21271096
38
1.9
38
97
0
139
31
16
10
41
1.82
21277217--21277251
18
1.9
18
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0
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31
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1.89
21277963--21277995
14
2.4
14
94
0
57
33
6
24
36
1.80
21279109--21279160
13
3.8
13
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75
0
1
23
0.91
21279109--21279163
3
18.7
3
78
14
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0
1
23
0.91
21282754--21282789
17
2.1
17
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0
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5
19
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1.72
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18
20
1.94
21287591--21287633
22
2.0
22
100
0
86
37
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18
1.94
21287824--21287918
28
3.6
24
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13
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4
15
1.66
21287838--21287921
28
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28
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1
132
46
30
3
19
1.66
21291417--21291491
39
1.9
39
97
0
141
37
12
13
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21292752--21294382
652
2.5
652
92
2
2698
28
17
13
41
1.87
21305241--21305270
12
2.5
12
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0
51
6
13
50
30
1.67
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18
1.9
18
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0
52
17
31
40
11
1.85
21306713--21306753
21
1.9
22
85
5
57
51
2
2
43
1.28
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12
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7
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3
0
50
1.17
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12
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2
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1.32
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110
2.4
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347
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1
27
1.39
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0
24
1.26
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2.1
22
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2
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1.07
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58
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136
49
12
0
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1.47
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2.0
25
100
0
102
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5
6.6
5
92
0
57
57
3
0
39
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1.9
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25
25
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28
1.99
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44
6.0
44
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288
31
28
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23
1.96
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89
2.9
89
89
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373
30
28
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22
1.97
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23
1.9
23
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38
0
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50
1.39
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20
3.1
19
90
5
82
55
6
0
37
1.27
21363051--21363110
19
3.1
19
88
7
86
55
6
0
38
1.27
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30
1.9
30
82
13
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42
1
19
36
1.62
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22
2.6
22
83
0
71
29
27
17
25
1.97
21369901--21369964
18
3.6
18
73
0
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39
14
10
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1.81
21369999--21370047
19
2.7
18
78
6
55
42
8
10
38
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21370249--21370397
45
3.3
45
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0
228
41
20
19
18
1.90
21371975--21372020
16
2.9
16
83
3
58
58
2
0
39
1.10
21371979--21372015
8
4.6
8
86
0
56
62
0
0
37
0.96
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1.9
28
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48
3
7
40
1.50
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2.8
63
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181
29
18
30
22
1.97
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19
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4.1
54
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1
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1.42
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2
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1.46
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12
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44
0
1
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1.11
21396140--21396355
120
1.8
120
100
0
432
42
1
6
49
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343