Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  278  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92241706--92241878
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49
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25
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16
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2.0
20
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1.48
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19
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19
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2.0
18
100
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24
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2
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19
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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38
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1.91
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33
20
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2.9
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32
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25
2.8
25
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37
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21
23
1.94
92359714--92359803
5
17.2
5
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18
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74
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22
2.6
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15
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3
77
1.05
92359719--92359803
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5.2
16
74
13
68
18
4
2
74
1.11
92359732--92359803
12
6.2
11
76
12
65
19
4
1
75
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92359732--92359783
6
9.0
6
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4
54
17
3
1
76
1.02
92359732--92359777
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2.1
22
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67
17
2
2
78
0.96
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10
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18
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1.76
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4.6
40
80
8
194
25
21
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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24
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2.1
21
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24
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1.96
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2.4
34
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32
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15
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3
16
24
1.57
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1.63
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200
24
22
28
25
1.99
92378841--92379003
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2.1
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197
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20
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1.99
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34
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361
25
28
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92404959--92405017
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93
1.9
92
84
6
238
30
10
6
52
1.61
92440877--92441146
49
5.6
49
72
13
170
25
30
17
25
1.97
92441026--92441130
46
2.2
46
83
6
122
26
31
17
24
1.97
92440877--92441205
48
6.9
48
72
10
172
24
30
17
27
1.98
92444899--92444939
21
2.0
21
85
0
55
48
19
12
19
1.80
92447669--92447712
23
1.9
23
86
9
63
56
11
11
20
1.64
92454935--92454986
25
2.1
25
96
0
95
59
15
11
13
1.61
92456444--92456497
24
2.2
24
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0
72
27
1
20
50
1.59
92461357--92461405
25
2.0
25
91
0
80
12
30
14
42
1.82
92464705--92464735
9
3.4
9
95
0
53
32
9
41
16
1.80
92477748--92477836
43
2.1
43
100
0
178
37
20
2
40
1.65
92480392--92480447
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24
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39
0
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1.44
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20
2.5
20
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0
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4
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36
1.71
92482617--92482660
20
2.2
20
87
0
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38
4
18
38
1.71
92487972--92488002
16
1.9
16
93
0
53
58
0
3
38
1.15
92487995--92488051
18
3.1
19
72
7
55
38
0
5
56
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92487979--92488051
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2.1
36
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7
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43
0
4
52
1.20
92491012--92491070
23
2.6
22
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10
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20
3
32
1.68
92496146--92496204
23
2.6
22
82
10
75
44
20
3
32
1.68
92496601--92496626
3
8.7
3
100
0
52
34
34
30
0
1.58
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18
2.0
18
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0
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16
8
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1.75
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2.0
87
96
0
313
35
17
12
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1.88
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48
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9
277
27
17
29
25
1.97
92507756--92508077
95
3.4
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83
6
370
27
18
29
25
1.98
92507803--92508071
143
1.9
143
82
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339
26
17
30
25
1.97
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2.1
44
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4
130
47
12
13
27
1.78
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151
1.9
147
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4
340
23
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19
20
1.95
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7
5.4
7
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0
58
68
0
31
0
0.90
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33
2.0
33
97
0
125
46
16
16
20
1.84
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26
2.0
26
82
13
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35
1
13
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1.53
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43
3.5
43
79
4
137
24
17
26
32
1.97
92524519--92524556
7
5.4
7
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0
58
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2
28
0
1.03
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2.1
44
95
0
164
46
13
13
27
1.80
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14
2.0
14
100
0
56
57
14
7
21
1.61
92531104--92531221
57
2.1
58
91
1
193
43
7
22
27
1.80
92548976--92549203
46
5.0
47
89
2
304
21
24
14
39
1.91
92551069--92551106
18
2.1
18
100
0
76
28
10
5
55
1.56
92567420--92567473
24
2.2
26
83
12
69
75
3
12
7
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92568382--92568649
142
1.9
143
81
5
328
29
16
20
32
1.95
92569232--92569339
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
92576436--92576473
14
2.9
13
85
11
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10
7
18
1.50
92576831--92576941
49
2.3
48
84
7
136
20
18
33
27
1.96
92577755--92577819
4
16.2
4
93
0
112
24
3
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1.66
92588845--92588887
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3.5
13
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12
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27
4
20
1.71
92588844--92588893
24
2.1
24
100
0
100
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170
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20
26
1.98
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3.6
46
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12
162
23
26
17
31
1.97
92594805--92595013
94
2.2
94
84
3
269
24
26
18
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343