Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  271  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89954507--89954691
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2.1
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2.0
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35
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2.0
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15
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30
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19
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2.0
30
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.99
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3
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152
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1168
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5
7
59
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.48
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126
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21
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0
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85
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1.60
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90161881--90162343
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1.86
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237
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4.0
31
93
0
212
38
19
19
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90167634--90167755
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2.5
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22
25
1.95
90167634--90167821
48
3.9
48
79
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175
31
19
23
25
1.98
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6.1
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12
200
28
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24
29
1.97
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259
28
15
24
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0
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17
15
24
1.89
90183604--90183688
43
2.0
43
82
13
104
30
29
15
24
1.95
90191107--90191147
18
2.2
19
83
12
50
7
0
21
70
1.11
90197690--90197720
15
2.1
15
93
0
53
29
0
41
29
1.56
90202114--90202145
3
10.7
3
100
0
64
31
0
0
68
0.90
90204370--90204399
15
1.9
16
93
6
53
56
0
6
36
1.26
90207140--90207178
19
2.1
19
90
4
62
41
7
10
41
1.68
90208207--90208232
9
2.9
9
100
0
52
46
11
0
42
1.40
90219071--90219128
30
1.9
30
96
0
107
32
17
15
34
1.91
90220398--90220439
15
2.7
16
85
3
59
54
4
0
40
1.21
90221235--90221293
12
4.8
12
72
4
55
74
15
5
5
1.17
90221232--90221317
24
3.9
23
71
23
69
74
16
4
4
1.16
90227174--90227218
21
2.1
21
83
0
54
35
22
4
37
1.74
90228274--90228333
15
3.9
15
82
4
75
45
21
11
21
1.84
90231299--90231354
26
2.2
26
96
0
103
30
7
25
37
1.82
90236811--90236844
14
2.5
13
85
4
50
61
0
0
38
0.96
90236972--90237381
169
2.4
169
85
8
520
35
21
18
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90238114--90238153
19
2.2
17
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8
53
35
2
0
62
1.09
90242549--90242607
29
2.0
31
86
6
86
35
5
0
59
1.20
90242684--90242746
30
2.1
30
82
8
76
50
3
11
34
1.54
90252308--90252359
21
2.5
21
74
0
59
30
26
28
13
1.94
90252564--90252643
28
2.8
29
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3
117
47
32
3
16
1.64
90261675--90261785
40
3.0
39
76
16
119
32
28
22
16
1.95
90262932--90262965
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
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2.1
12
100
0
50
60
0
24
16
1.36
90271000--90271070
25
2.8
26
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4
90
35
11
18
35
1.86
90274415--90274459
22
2.0
22
86
0
63
33
13
8
44
1.75
90274438--90274473
18
2.1
17
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5
54
41
13
13
30
1.84
90274593--90274626
6
5.7
6
89
0
50
47
11
20
20
1.81
90275603--90275635
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11.0
3
93
0
57
63
0
3
33
1.10
90296174--90296208
11
3.3
11
88
8
54
77
0
0
22
0.78
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38
3.9
38
93
0
237
11
20
30
38
1.87
90298946--90298993
22
2.1
23
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35
8
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39
1.79
90299013--90299051
16
2.4
16
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51
48
2
2
46
1.29
90299073--90299152
21
3.8
20
72
16
63
65
2
25
7
1.32
90302599--90302638
12
3.3
12
89
0
53
22
7
7
62
1.47
90303226--90303287
13
4.7
13
74
8
54
16
3
25
54
1.56
90303269--90303334
25
2.7
23
75
13
60
15
3
27
54
1.55
90303640--90303672
15
2.3
15
89
5
50
15
0
21
63
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90303883--90304403
123
4.1
125
85
3
704
36
15
18
29
1.92
90307429--90307549
54
2.2
54
84
7
147
47
8
1
42
1.43
90307467--90307719
129
1.9
131
91
3
413
50
6
4
38
1.49
90308701--90308725
7
3.6
7
100
0
50
60
12
0
28
1.32
90313039--90313215
94
1.9
95
89
1
275
14
14
15
55
1.69
90316845--90316873
14
2.0
15
93
6
51
48
24
6
20
1.74
90320275--90320310
17
2.1
17
100
0
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13
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37
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23
20
24
1.98
90326237--90326312
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3.0
25
77
7
75
2
25
1
71
1.07
90335592--90335765
44
4.0
44
90
2
269
25
29
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343