Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  1  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9847--9888
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19
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0
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132
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22215--22263
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2
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35786--35878
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2.0
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0
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2.4
120
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1.9
19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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2.0
22
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22
15
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102258--102302
19
2.3
20
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57
0
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20
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1
0
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0
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19
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7
0
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1.30
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2
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22
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2.0
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92
7
84
40
0
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0
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100
0
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0
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36
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19.7
3
78
0
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37
6
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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28
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0
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61
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2
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20
2.7
21
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60
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1
64
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0
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0
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20
20
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173
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20
22
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1.98
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2.4
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223
29
20
24
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1.99
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2.7
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148
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1.97
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21
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0
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21
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30
21
22
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1.99
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12.6
42
70
12
205
31
20
21
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
267757--268076
129
2.5
128
84
5
403
30
21
22
26
1.99
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3.5
15
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0
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0
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1.31
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54
46
48
0
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0
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2.5
16
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18
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35
0
7
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0
10
64
1.25
289179--289212
17
2.0
17
88
0
50
61
2
0
35
1.11
290825--290895
31
2.3
31
92
0
124
38
15
19
26
1.92
290825--290906
31
2.6
31
88
0
110
37
14
19
28
1.91
295458--295520
31
2.0
31
87
0
90
42
4
4
47
1.45
298572--298597
5
5.2
5
100
0
52
76
0
0
23
0.78
302207--302253
15
2.9
17
75
15
55
42
6
0
51
1.27
302300--302359
22
2.7
21
71
19
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45
0
16
38
1.48
318039--318148
24
5.2
24
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37
76
40
0
8
51
1.32
318037--318170
40
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100
0
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0
6
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13
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13
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55
31
0
12
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1.37
318572--318813
50
4.7
50
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4
288
26
24
29
19
1.98
318572--318821
100
2.4
103
87
6
355
26
24
29
20
1.99
320808--320832
12
2.1
12
100
0
50
48
0
12
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1.40
321259--321286
13
2.2
13
100
0
56
21
7
25
46
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
323508--323539
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
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50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
323634--323883
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
328611--328660
20
2.5
20
83
3
55
26
2
32
40
1.67
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2.0
32
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0
108
39
25
4
30
1.76
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47
2.4
47
85
0
159
36
19
11
32
1.88
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23
2.0
23
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4
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47
4
6
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1.50
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100
0
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0
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0
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17
2.2
19
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9
55
51
2
0
46
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29
2.0
30
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29
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2.0
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6
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27
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26
2.6
26
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45
5
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1.70
363672--363731
23
2.7
22
75
14
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5
3
23
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363833--363864
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2.1
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5
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53
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0
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9
4.7
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18
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0
0
33
0.92
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27
2.3
27
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0
3
35
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44
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25
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20
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3.4
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86
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349
25
22
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1.99
380958--381003
12
3.6
12
78
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0
0
34
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3
20.0
3
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10
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30
1
1
66
1.12
381702--381763
29
2.1
29
85
5
81
30
3
1
64
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
383874--384052
84
2.1
84
92
0
304
41
18
8
31
1.80
396131--396156
11
2.4
11
100
0
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0
7
15
0.99
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0
2
29
1.12
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2.6
25
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1
1
30
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2.6
22
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1
3
26
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396205--396364
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3.4
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75
12
130
62
2
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396381--396423
18
2.3
19
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0
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399840--399950
47
2.4
47
80
6
127
36
22
14
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373