Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3091372--3091417
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2.0
23
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18
2.3
19
91
4
68
19
23
16
40
1.91
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18
2.1
18
100
0
76
23
23
26
26
2.00
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23
2.0
23
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12
60
45
10
6
36
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12
3.4
11
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14
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44
0
0
55
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22
2.0
22
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50
0
0
50
1.00
3112537--3112885
172
2.0
172
100
0
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18
25
22
1.97
3113466--3113505
18
2.2
18
86
8
55
37
0
2
60
1.11
3113463--3113506
19
2.4
18
78
17
54
38
0
2
59
1.10
3115139--3115187
16
2.9
16
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6
53
67
8
0
24
1.18
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11
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7
9
0
82
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27
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17
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0
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1.00
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2.1
16
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0
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0
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42
2.0
42
100
0
172
33
18
9
38
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
4
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38
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38
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1.99
3130756--3130990
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23
24
29
1.99
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45
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7
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2.0
20
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20
0
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0
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0
0.73
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12
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0
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6
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15
15
15
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29
29
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20
1.98
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2.0
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2.3
177
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408
28
11
13
46
1.78
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181
2.5
177
77
10
395
29
10
13
46
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3211077--3211415
178
1.9
180
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5
447
30
10
13
46
1.76
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88
1.9
88
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0
320
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11
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90
3.8
89
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232
26
7
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2.9
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27
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21
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18
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163
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0
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2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373