Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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1.94
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Period
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A
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2.4
24
85
8
73
70
3
7
19
1.26
114332897--114332926
13
2.3
13
94
0
51
73
3
0
23
0.98
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30
2.0
31
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3
86
16
25
38
20
1.93
114335403--114335561
54
3.0
54
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23
23
17
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2.0
37
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0
150
24
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13
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114352653--114352716
27
2.4
27
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4
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1.27
114368320--114368647
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114368325--114368654
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90
90
1
518
31
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1.93
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45
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11
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25
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2.8
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2
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1.95
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20
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19
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4
0
64
1.12
114373436--114373493
19
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0
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16
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0
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15
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0
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13
2.5
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0
2
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16
26
28
1.97
114384112--114384208
50
1.9
50
91
0
158
26
14
27
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1
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63
1.22
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27
2.2
27
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28
1
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1.30
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1.9
24
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0
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2.0
29
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0
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1.56
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1.96
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4
327
23
22
18
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1.96
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2.3
121
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358
23
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1.95
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2.1
19
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1.58
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0
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0
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3.3
15
82
0
73
36
2
12
50
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
19
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0
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3.2
13
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50
0
25
25
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11
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0
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2.2
64
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0
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0
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284
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32
21
16
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373