Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  61  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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206
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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67
32
20
10
35
1.88
18535936--18536062
54
2.4
54
78
1
130
31
21
9
37
1.85
18535965--18536052
27
3.3
26
90
3
131
28
20
9
42
1.82
18536056--18536208
27
5.7
27
82
5
114
39
21
9
28
1.85
18536056--18536205
54
2.8
54
83
5
153
40
20
10
28
1.85
18536084--18536208
27
4.7
27
85
4
173
40
22
8
29
1.82
18536084--18536222
27
5.2
26
81
6
154
41
20
7
30
1.81
18536084--18536290
54
3.8
54
79
6
161
40
19
8
31
1.81
18536084--18536297
27
7.9
27
81
4
144
39
19
9
32
1.83
18537191--18537261
26
2.8
26
89
2
108
28
23
22
25
2.00
18537191--18537288
25
4.0
24
80
10
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29
22
22
25
1.99
18539843--18539988
27
5.4
27
84
0
193
27
20
8
43
1.81
18539818--18539988
54
3.2
54
88
0
225
28
21
9
40
1.84
18540020--18540198
27
6.6
27
75
7
119
41
19
8
30
1.81
18539978--18540118
54
2.6
54
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9
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37
21
12
28
1.89
18540020--18540144
54
2.3
56
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8
143
42
20
8
28
1.80
18541106--18541175
25
2.8
25
91
0
104
28
25
21
24
1.99
18541131--18541202
25
3.0
24
80
13
76
29
22
22
26
1.99
18541395--18541477
31
2.7
31
94
3
143
28
15
26
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18549980--18550185
39
5.3
39
82
4
218
20
30
13
34
1.92
18550031--18550094
19
3.3
19
72
20
60
14
29
17
39
1.88
18549983--18550085
20
5.2
20
63
21
56
17
33
14
34
1.90
18560575--18560636
32
1.9
32
83
6
81
43
8
8
40
1.64
18560795--18560827
17
1.9
17
88
11
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45
3
3
48
1.33
18560986--18561038
22
2.4
22
75
6
54
33
3
1
60
1.26
18570229--18570269
22
1.9
22
90
5
66
41
7
7
43
1.60
18571198--18571242
21
2.1
21
87
0
63
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0
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1.57
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11
2.3
11
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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18
2.4
18
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0
59
18
27
9
44
1.80
18575063--18575116
21
2.6
21
84
0
72
27
35
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12
1.92
18576746--18576970
48
4.7
48
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3
301
33
25
19
21
1.97
18585354--18585461
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
18587082--18587222
27
5.2
26
83
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165
19
24
21
34
1.96
18587082--18587222
54
2.6
53
90
2
210
19
24
21
34
1.96
18592497--18592630
26
5.2
26
93
0
232
32
7
23
35
1.83
18594047--18594102
23
2.4
23
85
8
69
26
26
16
30
1.96
18594065--18594129
23
2.7
24
88
7
87
26
26
16
30
1.97
18594231--18594359
27
4.8
27
85
6
165
19
24
21
34
1.97
18594231--18594357
54
2.4
54
93
0
218
18
25
22
33
1.97
18611646--18612043
125
3.2
124
88
2
555
30
16
16
36
1.90
18612101--18612228
34
3.7
33
77
6
121
43
14
0
40
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18614951--18615339
195
2.0
195
87
1
564
35
18
16
29
1.92
18621628--18621681
27
2.0
27
96
0
99
33
16
7
42
1.76
18628515--18628570
25
2.2
25
81
6
69
33
3
3
58
1.32
18628530--18628583
25
2.2
25
83
6
65
38
1
1
57
1.20
18636016--18636040
13
1.9
13
100
0
50
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20
16
32
1.94
18636586--18636764
27
6.6
27
82
6
191
27
15
27
29
1.96
18636588--18636738
82
1.9
81
87
4
223
27
15
27
28
1.96
18636584--18636764
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2.2
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4
213
28
14
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29
1.96
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2.0
44
100
0
178
39
6
17
35
1.77
18666814--18666840
13
2.1
13
100
0
54
14
29
33
22
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373