Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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177
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19
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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353
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22
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1.98
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26
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1.99
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30
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.16
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33
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1.81
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19
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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15
1.04
10544447--10544605
68
2.3
69
79
13
161
32
5
1
61
1.29
10548507--10548539
7
4.9
7
92
7
50
18
0
36
45
1.49
10548507--10548539
13
2.4
14
90
5
50
18
0
36
45
1.49
10548507--10548568
14
4.5
14
80
8
65
17
4
33
43
1.71
10549548--10549589
18
2.6
16
79
17
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21
33
0
45
1.52
10549550--10549586
18
2.1
18
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5
58
21
27
0
51
1.48
10550979--10551059
39
2.0
40
95
2
146
22
11
14
51
1.73
10552201--10552312
55
2.1
52
88
8
163
36
5
11
46
1.63
10552587--10553059
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5.1
94
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13
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34
7
5
52
1.52
10552587--10553051
193
2.5
185
84
11
591
34
7
5
52
1.53
10553207--10553374
17
9.6
17
71
18
123
46
15
2
35
1.59
10553207--10553416
9
23.7
9
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16
120
47
15
1
35
1.56
10553207--10553390
74
2.7
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15
216
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2
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1.57
10558866--10558913
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21
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33
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47
2
1.58
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7
7.1
7
78
10
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68
0
0
31
0.90
10559955--10560005
15
3.5
15
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68
0
0
31
0.90
10560115--10560184
31
2.2
32
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5
88
60
0
5
34
1.21
10561617--10562190
45
13.0
45
67
11
211
27
27
14
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10561617--10562111
90
5.6
90
85
3
632
27
27
14
31
1.95
10561950--10562111
81
2.0
82
86
1
227
25
30
13
30
1.94
10574172--10574223
7
7.3
7
77
12
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67
0
0
32
0.91
10574178--10574329
19
8.4
19
64
24
53
64
0
3
31
1.12
10574172--10574223
15
3.6
15
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5
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67
0
0
32
0.91
10574231--10574333
12
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12
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20
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0
1
33
1.05
10574233--10574303
14
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14
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19
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0
1
35
1.03
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7
8.4
7
73
19
55
62
0
0
37
0.95
10574231--10574333
23
4.5
23
72
17
81
64
0
1
33
1.05
10574232--10574333
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2.2
46
70
24
54
63
0
1
34
1.05
10574161--10574298
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4.1
33
74
13
113
62
0
3
33
1.18
10574233--10574333
16
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14
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23
57
64
0
1
33
1.05
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61
0
5
32
1.19
10575662--10575693
6
5.5
6
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7
57
0
0
12
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0.54
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2
0
10
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11
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4
0
9
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15
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62
0
5
31
1.19
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3.2
126
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472
37
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17
26
1.92
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178
6.2
177
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2
1394
29
20
19
30
1.97
10593592--10594630
357
2.9
356
89
1
1521
29
20
19
30
1.97
10594466--10594562
45
2.2
44
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7
124
26
23
19
29
1.98
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64
2.0
64
90
3
198
36
15
17
31
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10601233--10601369
60
2.3
60
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8
181
24
24
21
29
1.99
10601221--10601333
28
3.9
28
71
21
90
24
25
21
28
1.99
10601363--10601402
21
1.9
21
85
10
55
27
27
17
27
1.98
10609071--10609460
128
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126
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421
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15
25
1.92
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17
100
0
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5
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132
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0
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26
1.97
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28
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16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
46
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373