Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  237  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2.2
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44
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.99
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761
23
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1.99
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15
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23
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.88
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27
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18
18
24
1.94
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27
2.3
27
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2
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23
20
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80719465--80719545
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3.0
26
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7
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19
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32
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27
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80723575--80723613
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54
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18
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40
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1.99
80739341--80739517
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30
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25
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1.84
80759151--80759328
27
6.6
27
83
1
214
28
25
6
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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7
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1.80
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54
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54
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1.87
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1.9
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52
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1.99
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26
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1.99
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80767306--80767474
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3.1
53
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8
189
30
21
7
40
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80767287--80767446
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80767300--80767474
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2.2
81
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1.81
80767480--80767666
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54
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80767513--80767662
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1.99
80768645--80768799
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3.0
52
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4
228
27
20
22
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373