Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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0
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4
0.71
13437352--13437436
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18
26
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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1.8
118
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1.98
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205
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25
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2.2
37
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108
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31
17
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.88
13478913--13479194
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2.0
140
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335
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1.88
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13
65
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
19
94
5
65
77
0
0
22
0.76
13640982--13641034
19
2.7
19
73
2
52
71
3
3
20
1.17
13644154--13644183
9
3.3
9
100
0
60
33
10
10
46
1.71
13646391--13646549
43
3.7
44
79
9
166
32
25
18
23
1.97
13646391--13646549
86
1.9
85
81
9
198
32
25
18
23
1.97
13654087--13654124
14
2.6
15
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8
51
57
7
0
34
1.28
13660309--13660343
16
2.2
16
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0
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5
2
51
1.40
13660396--13660429
16
2.1
17
88
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52
70
0
2
26
1.01
13682501--13682649
27
5.4
27
92
3
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30
28
12
27
1.93
13682501--13682677
55
3.2
55
88
0
237
31
29
12
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1.93
13690474--13690625
27
5.6
27
92
3
232
30
28
13
27
1.94
13690474--13690650
55
3.2
55
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0
246
31
29
12
26
1.93
13696152--13696218
30
2.2
31
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2
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10
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43
1.59
13699761--13699789
14
2.0
15
93
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3
0
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0
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1.45
13715457--13715488
15
2.1
16
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11
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6
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18
1.50
13719748--13719923
46
3.8
46
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14
191
21
20
28
30
1.98
13719745--13719916
93
1.8
93
92
2
292
21
20
28
29
1.98
13727330--13727505
46
3.8
46
77
14
191
20
19
28
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13727327--13727498
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1.8
93
92
2
292
20
20
29
29
1.98
13737307--13737349
19
2.3
19
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8
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23
4
0
72
1.04
13737313--13737385
29
2.6
28
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20
8
0
71
1.11
13747504--13747613
33
3.3
33
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0
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1.99
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28
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25
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2.00
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2.9
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1.98
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1.9
19
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0
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1.80
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2.9
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7
20
40
1.80
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3.9
54
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0
217
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1.80
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2.3
22
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42
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1.92
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2.5
49
84
1
142
24
30
17
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1.97
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44
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2
280
31
35
14
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1.91
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19
2.1
19
100
0
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19
2.0
22
85
14
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7
15
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1.72
13771970--13772143
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21
27
29
1.99
13771967--13772137
93
1.8
93
93
0
297
22
21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13773875--13773931
29
1.9
30
82
10
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24
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24
14
1.92
13777136--13777541
47
8.6
47
93
1
641
32
8
30
29
1.87
13777136--13777541
192
2.1
190
91
2
658
32
8
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29
1.87
13787046--13787081
18
2.1
18
89
5
56
30
13
11
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1.79
13788323--13788396
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2.6
28
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2
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29
32
13
24
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13791781--13791952
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1.8
93
94
0
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29
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1.98
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3.8
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28
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21
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3.0
30
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13
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10
1.62
13794341--13794418
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373