Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6712301--6712359
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3.4
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15
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99
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42
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2.0
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0
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2
0
53
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.4
26
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4
34
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.13
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0
0
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1
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1.16
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2
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22
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1
60
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6857244--6857295
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59
1
1
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16
4.2
16
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129
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37
0
24
1.56
6866623--6866691
33
2.1
32
97
2
129
37
37
0
24
1.56
6870055--6870219
46
3.6
45
73
11
145
21
18
29
30
1.97
6870050--6870219
93
1.8
93
89
0
268
21
18
29
31
1.97
6875228--6875297
32
2.0
35
81
13
83
58
2
1
37
1.22
6879152--6879190
17
2.2
18
90
4
62
74
2
0
23
0.94
6879141--6879188
22
2.1
23
85
11
64
72
2
0
25
0.95
6882643--6882676
17
1.9
18
94
5
61
5
0
47
47
1.26
6889738--6889793
8
7.2
8
82
15
57
73
1
0
25
0.93
6889755--6889793
18
2.2
17
90
4
60
74
2
0
23
0.94
6891909--6892070
79
2.1
79
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0
225
21
15
19
43
1.88
6892748--6892980
77
2.9
78
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3
270
48
26
6
18
1.73
6894652--6894701
15
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15
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0
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10
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1.86
6900574--6900646
33
2.2
33
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7
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28
6
13
50
1.67
6901011--6901064
15
3.3
15
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18
54
44
0
1
53
1.11
6901097--6901136
13
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13
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16
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45
0
0
55
0.99
6901097--6901131
15
2.5
14
90
9
54
40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
2.8
22
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5
70
51
0
0
48
1.00
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22
2.0
22
85
0
59
34
18
0
46
1.50
6912421--6912582
54
3.0
53
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3
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24
14
28
32
1.95
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47
2.2
47
88
1
149
24
13
26
35
1.92
6912421--6912701
93
2.8
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14
244
24
14
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1.95
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40
2.6
40
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25
17
26
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1.97
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17
5.6
17
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7
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12
12
36
1.80
6915633--6915737
35
2.9
35
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174
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1.79
6915641--6915739
18
5.6
18
87
4
148
39
12
12
36
1.80
6916048--6916081
12
2.9
11
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12
50
35
0
0
64
0.94
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21
5.3
21
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20
61
36
2
0
59
1.18
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16
2.0
16
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6
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35
0
0
64
0.94
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25
2.8
24
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12
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36
1
4
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1.27
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3
14.3
3
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4
79
34
0
0
65
0.93
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21
4.5
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22
1
24
1.53
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36
2.3
36
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51
18
2
27
1.58
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15
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15
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22
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45
0
0
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2.3
29
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43
0
0
56
0.99
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3.0
20
70
4
59
40
0
3
56
1.16
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21.9
9
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45
21
1
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1.59
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69
2.0
69
89
0
207
43
22
1
31
1.63
6925227--6925253
12
2.2
12
100
0
54
33
7
25
33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6929003--6929064
21
3.0
21
92
0
97
25
19
51
3
1.62
6929296--6929361
31
2.1
31
94
0
114
16
9
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53
1.71
6929428--6929628
43
4.7
43
89
0
303
27
30
17
23
1.97
6929428--6929628
86
2.3
86
93
0
339
27
30
17
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1.9
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10
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77
2
10
10
1.08
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7
100
0
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0
0
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0
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34
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0
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24
14
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1.95
6973572--6973947
183
2.1
180
95
4
684
38
3
4
53
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373