Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   

This is table  228  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77507590--77507706
31
3.8
31
78
4
94
42
0
3
52
1.23
77507692--77507755
25
2.5
24
78
9
65
39
4
3
53
1.38
77511900--77511953
26
2.1
26
100
0
108
33
20
20
25
1.97
77514957--77515134
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
77514958--77515113
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
77514954--77515134
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
77523097--77523274
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
77523098--77523253
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
77523094--77523274
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
77530931--77531049
47
2.5
47
95
0
211
24
17
27
30
1.97
77534069--77534133
15
4.4
15
77
9
71
10
15
13
60
1.60
77534065--77534133
30
2.3
31
82
9
90
10
14
17
57
1.63
77536866--77537131
46
5.7
46
73
11
247
22
19
28
28
1.98
77536859--77537122
93
2.8
93
91
0
429
22
20
28
28
1.98
77554599--77554635
12
3.0
13
84
11
51
29
40
18
10
1.85
77562538--77562710
42
4.1
42
78
5
170
31
24
13
30
1.94
77566331--77566468
50
2.8
49
84
6
163
28
28
17
25
1.97
77569928--77570025
24
4.0
24
73
5
72
39
17
20
22
1.92
77569927--77569999
25
3.0
24
75
2
65
39
16
20
23
1.92
77571453--77571478
9
2.9
9
100
0
52
23
19
11
46
1.82
77573181--77573223
21
2.0
21
86
0
59
51
4
11
32
1.59
77576502--77576554
25
2.2
24
86
10
72
41
22
18
16
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77582342--77582418
38
2.0
38
100
0
154
36
0
18
45
1.49
77587001--77587039
13
2.9
13
84
3
51
76
2
2
17
1.01
77587519--77587547
13
2.1
14
93
6
51
82
10
0
6
0.83
77588762--77588808
20
2.2
23
85
11
64
31
6
2
59
1.34
77589617--77589641
12
2.1
12
100
0
50
16
0
16
68
1.22
77592447--77592746
47
6.4
47
92
0
465
32
7
31
28
1.85
77604279--77604673
47
8.4
47
91
1
549
33
10
30
25
1.89
77604792--77604908
37
3.2
37
92
2
182
23
17
30
28
1.97
77606704--77607126
40
10.6
40
97
0
783
23
22
29
25
1.99
77611446--77611840
47
8.4
47
91
1
549
33
10
30
25
1.89
77611959--77612075
37
3.2
37
92
2
182
23
17
30
28
1.97
77615708--77615746
3
13.3
3
94
5
71
0
30
0
69
0.89
77615749--77615828
38
2.1
38
88
4
117
22
11
7
58
1.57
77621352--77621394
17
2.7
15
80
13
50
62
0
16
20
1.32
77627045--77627318
46
6.0
46
89
0
388
22
22
14
39
1.91
77640259--77640283
13
1.9
13
100
0
50
68
0
8
24
1.16
77641893--77642037
54
2.7
54
93
3
238
17
24
22
34
1.96
77641896--77642055
27
5.9
27
82
12
177
19
25
21
34
1.96
77641896--77642055
81
2.0
81
84
7
209
19
25
21
34
1.96
77644666--77644700
17
2.1
17
100
0
70
34
11
20
34
1.88
77645979--77646136
45
3.5
44
81
8
142
23
13
27
34
1.93
77646072--77646139
19
3.3
19
70
21
64
17
13
29
39
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77646055--77646146
44
2.1
45
91
2
150
22
13
29
34
1.92
77649460--77649520
21
2.8
21
75
5
59
54
4
8
32
1.52
77651481--77651520
13
3.3
12
86
10
55
0
5
10
85
0.75
77651481--77651524
6
7.5
6
82
12
56
0
4
11
84
0.77
77651479--77651552
30
2.5
30
78
8
80
5
5
9
79
1.04
77652104--77652201
50
2.0
50
89
0
151
41
12
15
30
1.83
77665030--77665120
46
2.0
46
97
0
173
37
34
6
21
1.80
77675991--77676058
36
2.0
34
91
8
111
61
8
5
23
1.47
77680993--77681037
21
2.1
21
87
0
63
17
0
24
57
1.40
77682553--77682612
21
2.9
21
94
0
111
28
26
28
16
1.97
77682981--77683038
15
3.8
15
88
2
89
51
12
0
36
1.39
77689478--77689514
18
2.1
18
94
0
65
18
21
37
21
1.94
77691081--77691118
19
2.1
18
90
9
60
60
2
0
36
1.11
77692369--77692408
19
2.2
18
90
4
62
27
0
7
65
1.20
77693161--77693190
15
1.9
16
93
6
53
50
6
6
36
1.55
77706338--77706380
21
2.1
20
82
4
50
41
18
18
20
1.90
77707985--77708023
18
2.1
19
85
4
53
7
23
2
66
1.30
77708017--77708083
30
2.2
30
83
0
80
11
23
0
64
1.27
77708041--77708092
18
2.9
18
82
0
59
13
19
1
65
1.36
77708059--77708083
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
77708085--77708116
12
2.7
12
90
0
55
25
18
12
43
1.85
77708164--77708220
5
11.0
5
75
20
55
3
19
1
75
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77708164--77708228
16
4.3
14
78
16
67
3
18
3
75
1.07
77710612--77710654
21
2.1
20
86
4
59
41
20
18
18
1.90
77720167--77720206
21
1.9
21
84
0
53
65
12
0
22
1.26
77722295--77722342
22
2.2
22
92
0
78
31
8
22
37
1.84
77723683--77723991
41
7.6
40
83
4
325
33
24
16
25
1.96
77724280--77724342
21
3.0
21
76
2
54
50
23
0
25
1.49
77724280--77724346
28
2.4
28
85
7
82
50
23
0
25
1.49
77724527--77724612
43
2.0
42
84
4
111
27
6
26
38
1.82
77724971--77724995
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
77725674--77725784
40
2.8
40
78
9
129
37
18
19
24
1.93
77726360--77726395
18
1.9
19
88
5
56
50
2
25
22
1.63
77726774--77726823
11
4.4
11
80
9
64
40
8
14
38
1.75
77730083--77730759
241
2.8
241
95
0
1203
34
17
14
33
1.90
77730879--77731006
9
13.6
9
75
9
112
46
20
0
32
1.56
77730896--77730973
39
2.0
39
97
0
147
46
21
0
32
1.52
77730892--77731004
57
2.0
57
87
0
163
46
22
0
30
1.58
77739293--77739323
15
2.0
16
93
6
55
32
16
51
0
1.44
77739602--77739668
31
2.2
31
83
0
80
17
2
17
61
1.47
77739721--77739818
43
2.3
42
84
8
126
22
25
25
26
2.00
77739743--77739832
43
2.1
43
87
4
128
21
33
21
24
1.97
77740456--77740514
24
2.5
24
85
0
73
11
35
6
45
1.67
77742550--77742720
39
4.3
39
85
6
202
25
21
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77742497--77742720
79
2.8
79
81
7
222
25
20
27
25
1.99
77745626--77745863
49
4.8
49
81
3
278
28
25
18
26
1.98
77745639--77745870
100
2.3
99
84
2
304
28
25
18
26
1.98
77756284--77756315
12
2.6
13
85
14
50
65
3
0
31
1.08
77758368--77758423
3
18.7
3
85
14
80
33
0
1
64
1.04
77758368--77758423
19
3.1
18
87
12
80
33
0
1
64
1.04
77758432--77758473
22
1.9
22
90
0
66
76
2
11
9
1.12
77759346--77759392
23
2.0
23
88
8
69
8
4
36
51
1.52
77765474--77765529
21
2.8
21
78
10
64
37
16
28
17
1.91
77766033--77766073
18
2.3
18
84
12
50
41
17
2
39
1.62
77769689--77769718
16
1.9
15
93
6
51
33
30
13
23
1.93
77780060--77780101
21
2.0
22
90
4
68
14
7
11
66
1.43
77791510--77791906
109
3.6
109
80
3
411
23
14
27
34
1.94
77792954--77793096
37
3.9
37
89
3
225
25
30
18
25
1.98
77792959--77793110
74
2.1
74
94
0
268
26
29
17
26
1.98
77793246--77793499
48
5.3
48
94
0
409
30
28
6
34
1.82
77793471--77793515
13
3.5
13
81
0
63
40
28
0
31
1.57
77793469--77793525
26
2.2
26
100
0
114
38
28
0
33
1.57
77793421--77793573
74
2.1
74
97
0
288
33
28
4
33
1.78
77793373--77793603
122
1.9
122
94
0
408
32
27
5
34
1.79
77793495--77793603
48
2.3
48
96
0
200
33
27
5
33
1.80
77800140--77800182
20
2.2
20
95
0
77
34
32
25
6
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77809182--77809224
17
2.5
17
84
0
59
53
2
20
23
1.57
77816896--77817105
40
5.3
40
81
4
205
24
27
22
25
2.00
77822380--77822418
11
3.4
11
83
13
51
48
0
2
48
1.15
77822395--77822435
17
2.6
17
88
11
61
48
0
0
51
1.00
77822367--77822448
28
2.8
28
78
7
74
53
0
2
43
1.13
77823463--77823550
44
2.0
44
86
8
126
20
20
26
32
1.97
77828725--77828754
7
4.3
7
100
0
60
43
26
0
30
1.55
77834034--77834089
24
2.3
24
76
11
60
30
21
28
19
1.98
77834150--77834403
24
10.5
24
86
5
307
23
22
39
14
1.91
77839418--77839495
29
2.7
28
80
11
95
25
14
30
29
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373