Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5130945--5131017
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61
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0
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110
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5188538--5188647
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18
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22
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2
0
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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110
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53
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0
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19
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3
2
63
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5354810--5354861
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1
1
48
1.24
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43
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0
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18
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1.97
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18
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54
36
0
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1.54
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25
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1
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26
7
8
56
1.56
5362541--5362629
28
3.1
28
79
9
90
48
28
0
23
1.51
5362633--5362701
22
3.1
21
79
8
75
27
44
2
24
1.68
5362782--5362873
36
2.6
36
83
8
100
35
41
1
21
1.61
5362933--5363026
46
2.0
46
95
0
170
42
24
2
30
1.66
5363198--5363364
41
4.1
42
86
7
184
16
20
23
38
1.93
5363725--5363753
14
2.0
15
93
6
51
20
6
17
55
1.65
5363869--5363997
50
2.5
51
87
5
181
37
16
21
24
1.93
5363973--5364181
31
6.8
31
91
3
307
26
19
28
26
1.99
5368132--5368359
46
4.9
46
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3
260
41
14
22
20
1.89
5368143--5368358
93
2.3
92
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2
263
41
15
22
20
1.89
5370748--5370850
53
2.0
52
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145
29
15
24
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1.96
5370761--5370875
53
2.3
50
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10
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29
16
23
30
1.96
5370761--5370895
53
2.7
50
78
12
138
27
17
25
29
1.97
5371870--5371961
22
4.1
22
72
12
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59
6
1
32
1.30
5372113--5372203
27
3.5
26
75
8
71
50
5
8
35
1.57
5372360--5372479
46
2.6
43
80
18
136
59
3
2
35
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5372366--5372503
24
5.7
25
76
14
130
57
4
2
35
1.30
5372406--5372471
14
5.3
13
72
20
61
59
3
0
37
1.13
5372362--5372493
48
2.8
49
82
14
170
57
3
2
36
1.29
5374040--5374086
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
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8.0
46
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24
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1.93
5374347--5374696
84
4.0
88
89
4
455
22
24
15
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1.93
5374526--5374685
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38
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1.96
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2.5
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3.0
54
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22
3
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1.45
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4.3
39
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1
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22
25
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32
1.97
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135
2.5
135
89
0
502
29
19
22
28
1.98
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2.0
15
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24
6
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2.5
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5
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25
1.94
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2.0
31
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0
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26
1.98
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25
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2.00
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3.3
31
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0
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24
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2.1
17
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34
1.88
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2.7
46
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2
149
28
15
26
29
1.96
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42
3.6
43
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147
31
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1.95
5400927--5401041
42
2.7
43
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4
171
32
14
25
27
1.95
5402542--5402584
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2.0
22
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53
11
0
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1.37
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21
2.0
21
100
0
84
38
9
19
33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5405499--5405572
36
2.1
36
97
0
139
54
14
8
22
1.67
5406157--5406229
36
2.0
36
91
0
119
47
9
9
32
1.68
5406272--5406404
43
3.3
42
77
11
118
42
11
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1.80
5406339--5406411
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2.0
36
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0
110
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10
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1.71
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2.4
42
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5
121
41
9
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1.78
5406497--5406785
141
2.0
141
91
2
463
41
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34
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183
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2.5
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10
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1.9
36
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0
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10
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1.70
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45
2.0
45
91
0
144
40
11
14
34
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373