Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  364  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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242
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1
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23
20
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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120617426--120617498
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21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120637413--120637457
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31
0
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40
1.57
120637413--120637457
22
2.1
21
91
4
72
31
0
28
40
1.57
120637698--120637727
7
4.3
7
100
0
60
0
0
60
40
0.97
120640779--120640812
14
2.4
14
100
0
68
17
8
20
52
1.71
120641133--120641176
22
1.9
22
86
9
61
56
4
0
38
1.20
120641207--120641411
43
4.8
43
84
4
180
21
18
30
29
1.97
120641233--120641411
86
2.1
86
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2
288
21
18
31
27
1.97
120643090--120643128
20
2.0
20
94
0
69
53
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23
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120645153--120645282
50
2.6
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2
190
36
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20
25
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120645258--120645437
31
5.8
30
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5
243
27
20
27
24
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120645258--120645429
93
1.8
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90
4
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28
19
27
24
1.98
120645459--120645617
49
3.5
47
85
8
188
28
13
27
29
1.95
120646367--120646594
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5.0
46
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1
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21
24
15
38
1.92
120648674--120648698
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
120648957--120649024
30
2.3
30
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5
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27
19
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47
1.72
120649895--120649945
23
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23
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0
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1.76
120650103--120650199
23
4.3
23
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2
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28
1.34
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0
11
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1.38
120650300--120650442
3
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120654060--120654095
18
2.0
18
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58
2
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2.0
24
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0
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0
52
1.20
120658035--120658068
6
5.7
6
96
0
59
0
61
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
11
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0
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14
4
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70
1.30
120664340--120664384
22
2.0
22
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0
72
15
4
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1.34
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17
2.2
17
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51
0
0
48
1.00
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22
2.3
22
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0
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1.40
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120689058--120689131
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0
0
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0
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2.0
23
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2.4
24
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1
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1.35
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1.9
17
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24
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2.2
24
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1.43
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30
6
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1.20
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7
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1.20
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24
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0
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9
1
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1.43
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24
2.2
24
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0
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1
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1.43
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15
1.9
16
93
6
53
30
6
0
63
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120735619--120735658
18
2.2
19
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12
5
75
1.18
120739788--120739849
25
2.3
27
75
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38
0
1
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1.07
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2.2
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0
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1.9
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120748240--120748304
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2.1
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0
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102
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20
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1.9
31
89
0
91
52
3
6
37
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373