Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  349  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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28
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25
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2
19
43
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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3.4
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1
40
1.20
116469063--116469150
24
3.7
23
73
15
81
54
1
1
43
1.15
116469041--116469129
33
2.7
33
79
10
92
55
2
1
41
1.20
116469073--116469114
20
2.0
22
86
9
61
57
2
0
40
1.12
116469080--116469150
22
3.1
22
80
11
81
56
0
0
43
0.99
116472909--116472990
26
3.2
24
80
13
85
31
6
4
57
1.44
116472992--116473058
22
2.9
23
72
17
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26
2
4
65
1.26
116473345--116473379
12
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12
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0
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25
0
0
74
0.82
116474868--116474922
19
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16
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51
30
0
3
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1.10
116479060--116479088
15
1.9
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100
0
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116480597--116480669
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27
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19
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24
4
20
50
1.65
116481619--116481707
22
4.0
22
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15
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21
44
1.74
116481622--116481770
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2.2
68
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2
210
28
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20
44
1.75
116482166--116482224
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1.76
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14
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116483140--116483182
19
2.3
19
100
0
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2
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0
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0
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0
0
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16
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16
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46
11
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32
1.72
116494720--116494773
18
3.1
17
79
12
56
59
1
3
35
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116494854--116494884
3
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3
92
0
53
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3
0
29
1.06
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26
2.6
26
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66
1
10
22
1.30
116495177--116495233
30
1.9
30
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3
71
57
5
10
26
1.53
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13
2.2
14
94
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16
3
0
80
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2.4
22
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12
28
0
60
1.32
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64
2
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1.99
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2.3
180
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625
26
21
21
30
1.99
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2.5
135
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537
25
20
23
30
1.98
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5
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19
19
1.90
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15
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68
61
2
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28
1.35
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2.0
25
100
0
100
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24
24
1.94
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11
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0
8
28
1.26
116529117--116529272
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25
70
19
85
66
0
6
26
1.21
116529118--116529227
50
2.2
51
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134
62
0
7
29
1.28
116529238--116529272
14
2.6
14
95
4
63
82
0
0
17
0.66
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2.1
21
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63
81
0
2
15
0.78
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14
4.1
14
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15
62
56
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29
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116529501--116529578
3
26.7
3
72
10
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1
8
32
1.38
116529500--116529581
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1
10
31
1.42
116531975--116532045
35
2.0
35
86
5
99
28
23
9
38
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116544207--116544255
19
2.6
19
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12
73
61
4
4
30
1.33
116544233--116544330
21
5.0
21
66
20
59
57
4
2
36
1.30
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21
2.2
21
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7
60
59
0
0
40
0.97
116544365--116544413
23
2.1
24
88
3
73
61
4
0
34
1.15
116544207--116544460
10
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9
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73
58
3
2
35
1.30
116544283--116544471
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18.3
10
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1
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1.24
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3.0
13
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0
2
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1.09
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2
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1.20
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2.3
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35
0
1
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1.05
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19
3.2
19
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61
35
0
1
63
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373