Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  293  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
99400059--99400101
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Indices
Period
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Copy
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Indels
Score
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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A
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(0-2)
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11
25
33
1.91
99551469--99551566
27
3.5
28
88
2
126
25
13
29
31
1.93
99551498--99551579
27
3.0
27
87
5
94
29
12
25
32
1.92
99561028--99561100
15
5.0
16
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24
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20
26
0
53
1.46
99562225--99562264
20
2.0
20
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25
7
0
67
1.16
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22
100
0
106
22
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22
11
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99578609--99578674
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2.1
31
97
0
123
19
22
22
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1.96
99579094--99579362
48
5.6
48
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258
24
28
18
28
1.98
99579089--99579363
96
2.9
96
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2
329
24
28
18
29
1.98
99579094--99579362
144
1.9
144
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7
332
24
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18
28
1.98
99586007--99586073
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2.1
31
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2
107
28
22
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40
1.84
99586013--99586102
32
2.8
32
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0
99
31
25
8
34
1.87
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28
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28
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0
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25
29
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28
1.98
99586180--99586306
56
2.3
56
88
0
182
25
29
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1.97
99586205--99586306
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1.95
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55
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1.98
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14
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0
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0
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1.58
99617131--99617404
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49
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300
27
18
24
29
1.98
99617126--99617407
100
2.8
100
91
0
449
26
19
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.7
48
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4
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26
29
16
27
1.97
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107
2.0
107
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1
376
38
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13
32
1.86
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26
2.2
26
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0
105
36
10
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19
1.86
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25
2.5
24
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79
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17
17
17
1.84
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27
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0
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1.90
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17
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0
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1.45
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40
1.59
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13
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13
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72
0
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1.13
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18
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72
0
10
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1.12
99687974--99688008
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54
71
0
11
17
1.14
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5
10.2
5
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2
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0
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1.57
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4.5
10
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0
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0
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28
1.57
99689389--99689435
15
3.1
15
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0
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0
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1.58
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5.3
45
91
0
345
19
19
21
40
1.92
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5.2
6
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0
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16
19
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1.84
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18
129
36
12
14
35
1.85
99690331--99690466
54
2.5
53
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9
150
36
13
14
35
1.85
99690263--99690545
72
3.8
72
77
10
205
35
12
15
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99690504--99690545
18
2.3
18
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0
57
38
11
16
33
1.86
99691432--99691485
28
2.0
27
81
3
63
42
18
3
35
1.68
99702579--99702704
40
3.2
40
89
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26
28
21
23
1.99
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7.4
5
88
5
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15
2
0
81
0.80
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2.0
93
96
0
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1.95
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2.0
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2
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0
0
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0
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0
0
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0.61
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141
1.8
141
83
1
338
40
16
12
30
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          369   370   371   372   373