Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  183  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61331109--61331278
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3.7
46
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1.99
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2.0
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407
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1.96
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7.6
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4
409
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26
26
1.99
61358392--61358728
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3.0
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21
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28
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1.98
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19
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1.97
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1.8
85
84
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212
23
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4.6
40
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24
28
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25
1.99
61390072--61390252
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2.3
81
84
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239
24
28
21
25
1.99
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2.2
79
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3
220
25
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27
25
1.99
61397711--61397933
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209
25
21
27
25
1.99
61397791--61397968
79
2.2
80
80
3
191
25
21
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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6
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24
21
27
26
1.99
61404093--61404262
79
2.2
78
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216
24
21
28
25
1.99
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48
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26
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1.99
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2.0
42
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2.0
22
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2.0
25
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14
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2.3
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1.97
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2.3
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160
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20
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1.98
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2.0
20
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20
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1.98
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203
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1.98
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101
1.9
101
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279
24
18
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29
1.98
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2.0
22
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78
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3.4
18
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1.67
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21
1.74
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5.6
39
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207
25
27
21
25
1.99
61471227--61471451
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2.8
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240
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24
1.99
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1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
25
1.99
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1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
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2.2
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2.0
30
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25
42
8
23
1.82
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1.98
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51
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14
26
1.94
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4.2
43
85
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193
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14
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1.94
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1.8
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310
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20
20
1.98
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29
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20
1.98
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24
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21
39
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61545813--61545891
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50
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1.70
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25
20
26
1.99
61556582--61556613
12
2.6
13
90
9
50
50
25
6
18
1.70
61559707--61559784
31
2.6
28
77
15
77
42
7
10
39
1.68
61559718--61559779
30
2.0
33
87
9
94
41
9
11
37
1.74
61560710--61560761
20
2.7
20
84
3
70
28
3
0
67
1.08
61562205--61562274
29
2.4
29
85
2
88
37
4
5
52
1.45
61563375--61563438
28
2.2
29
83
5
85
42
10
9
37
1.73
61564300--61564341
20
2.1
20
90
0
66
57
0
4
38
1.20
61564975--61565019
18
2.5
18
85
7
56
31
0
2
66
1.04
61567202--61567665
93
4.9
98
77
9
349
27
19
29
23
1.98
61567205--61567668
49
9.8
49
76
8
372
27
19
29
23
1.98
61567762--61567786
11
2.3
11
100
0
50
28
0
20
52
1.47
61573410--61573481
12
5.8
12
78
13
74
15
6
4
73
1.20
61575438--61575468
16
1.9
16
93
0
53
58
6
0
35
1.24
61577093--61577117
3
8.3
3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
61578481--61578535
11
5.5
10
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12
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36
10
18
34
1.86
61578583--61578640
25
2.4
25
88
2
82
34
20
18
25
1.96
61578849--61578963
31
3.7
31
94
1
196
33
17
26
23
1.96
61586397--61586574
27
6.6
27
81
3
169
29
28
15
26
1.96
61587056--61587082
12
2.2
12
100
0
54
40
0
7
51
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61594515--61594692
27
6.6
27
82
3
178
29
28
15
26
1.96
61595147--61595173
12
2.2
12
100
0
54
40
0
7
51
1.30
61600773--61600849
38
2.0
38
100
0
154
42
12
10
33
1.77
61605884--61606027
40
3.6
40
84
5
175
26
25
25
23
2.00
61621167--61621312
46
3.1
47
74
11
140
31
28
18
21
1.97
61623685--61623764
30
2.7
30
78
7
90
55
12
17
15
1.70
61623685--61623755
15
4.7
15
79
6
81
56
9
18
15
1.66
61623687--61623764
15
5.2
15
76
6
70
55
12
16
15
1.70
61626681--61626856
46
3.8
46
76
12
180
30
29
19
20
1.97
61626688--61626860
93
1.9
93
91
0
283
28
30
20
20
1.98
61633814--61633854
20
2.0
20
85
9
55
29
9
17
43
1.80
61634037--61634077
4
10.0
4
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2
73
73
2
0
24
0.96
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40
9.9
40
92
0
639
22
20
29
27
1.99
61635885--61635935
25
2.0
25
88
0
75
37
13
27
21
1.91
61637170--61637206
4
9.0
4
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3
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72
2
0
24
0.97
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118
2.0
118
98
0
454
30
20
20
27
1.98
61648223--61648280
19
2.9
19
82
5
53
77
5
17
0
0.94
61661159--61661302
37
3.9
37
96
0
254
24
19
31
25
1.98
61662566--61662757
40
4.8
40
88
0
276
23
21
28
25
1.99
61662976--61663086
57
1.9
57
87
1
159
25
18
27
28
1.98
61664533--61664711
85
2.1
85
98
0
349
37
8
27
26
1.85
61666897--61667430
47
11.1
47
87
5
726
31
12
29
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61666897--61667430
145
3.7
144
88
5
783
31
12
29
26
1.93
61667119--61667193
22
3.3
22
65
17
62
28
13
32
26
1.94
61667266--61667340
22
3.3
22
66
23
64
29
14
32
24
1.95
61667404--61667494
46
2.0
46
84
0
119
32
9
31
25
1.89
61667639--61667783
37
3.9
37
95
0
245
24
18
31
26
1.98
61669612--61669701
27
3.3
27
84
0
117
21
17
18
42
1.90
61670021--61670083
18
3.5
18
84
0
81
17
20
19
42
1.89
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3.3
40
89
2
201
23
20
27
28
1.99
61674310--61674529
40
5.6
38
78
11
167
24
21
27
26
1.99
61677917--61678134
46
4.6
46
73
21
175
27
18
30
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373