Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  281  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95404054--95404133
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2.0
40
100
0
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35
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22
26
25
2.00
95416521--95416744
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1.9
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4
382
25
22
26
25
2.00
95416521--95416744
40
5.6
40
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1
369
25
22
26
25
2.00
95421738--95421806
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11
72
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1.83
95421720--95421858
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1.84
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3.2
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0
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2.1
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3
154
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21
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2.0
106
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0
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9
300
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20
29
27
1.98
95484427--95484681
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3.4
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11
295
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20
29
27
1.98
95489335--95489556
40
5.6
39
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5
232
24
20
27
27
1.99
95489338--95489556
80
2.7
79
80
9
257
24
21
26
27
1.99
95489385--95489589
80
2.6
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83
7
220
25
20
27
26
1.99
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2.4
56
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2
187
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1.9
16
93
0
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41
6
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38
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95499464--95499507
19
2.3
19
84
7
54
50
2
13
34
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95501189--95501365
27
6.5
27
83
3
140
27
29
16
26
1.97
95501215--95501365
54
2.8
55
84
4
207
27
29
16
27
1.97
95501210--95501365
82
1.9
81
85
3
215
27
29
16
26
1.96
95509170--95509346
27
6.6
27
83
3
169
28
28
15
27
1.96
95509191--95509345
81
1.9
81
85
7
217
28
29
15
27
1.96
95511044--95511132
41
2.1
42
85
2
117
24
19
19
37
1.94
95511321--95511945
45
13.9
45
73
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385
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21
18
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1.96
95511322--95511763
178
2.5
177
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604
27
22
17
32
1.96
95512346--95512461
41
2.7
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26
27
14
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1.95
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9
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27
26
18
27
1.98
95528854--95529074
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5.6
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24
1.99
95528854--95529024
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4.3
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28
27
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23
1.99
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2.1
78
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226
29
27
20
23
1.99
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6.8
40
90
1
402
26
28
22
22
1.99
95533785--95534053
119
2.2
120
89
1
416
27
28
21
22
1.99
95534069--95534111
18
2.3
19
80
4
52
39
23
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1.75
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4.8
40
88
2
240
28
30
19
21
1.98
95542110--95542327
80
2.7
79
85
4
262
27
28
20
22
1.99
95542341--95542383
18
2.3
19
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4
52
39
23
4
32
1.75
95544677--95544709
12
2.6
13
85
4
50
6
39
30
24
1.79
95546469--95546600
49
2.7
49
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155
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29
17
26
1.97
95546659--95546786
47
2.7
47
85
3
170
25
28
17
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95551592--95551628
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16
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8
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2.1
13
100
0
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29
14
1.94
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32
2.1
33
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19
20
22
1.94
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2.2
23
81
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34
26
28
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1.92
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2.0
13
100
0
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0
1.46
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24
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141
39
16
19
24
1.92
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24
4.4
27
79
16
129
36
16
21
25
1.94
95588788--95588904
52
2.2
52
89
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173
36
16
21
25
1.94
95588932--95589181
51
4.9
51
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1
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33
12
23
30
1.92
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2.3
27
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1.93
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1.98
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29
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29
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27
30
13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95613064--95613563
173
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173
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0
901
31
24
14
30
1.94
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29
2.3
29
85
5
93
27
30
13
27
1.94
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29
2.7
30
82
13
110
29
30
15
25
1.96
95616288--95616504
46
4.6
45
77
11
197
23
30
17
27
1.97
95616335--95616525
46
4.1
45
74
11
152
24
30
18
26
1.98
95617822--95617945
43
2.9
42
81
3
142
32
32
17
17
1.94
95618201--95618286
43
2.0
43
97
0
163
37
16
15
31
1.89
95627116--95627201
43
2.0
43
90
0
136
29
29
20
20
1.98
95635751--95636008
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6.5
40
80
4
211
25
20
27
26
1.99
95635826--95636008
79
2.3
79
80
5
201
25
20
27
26
1.99
95643655--95643877
40
5.6
40
83
6
213
24
20
27
27
1.99
95643655--95643879
80
2.8
79
82
7
242
24
20
28
27
1.99
95643730--95643912
79
2.3
80
81
1
217
25
20
27
26
1.99
95643655--95643912
119
2.2
120
80
4
281
25
20
27
26
1.99
95645572--95645658
45
1.9
45
90
0
138
25
14
24
35
1.94
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21
2.4
20
79
3
53
36
26
8
28
1.85
95650223--95650446
40
5.6
40
76
10
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35
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28
20
1.93
95650243--95650446
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2
286
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15
28
22
1.94
95657768--95657800
14
2.3
15
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5
59
42
18
21
18
1.89
95659469--95659565
25
3.9
25
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0
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20
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1.98
95659559--95659619
25
2.5
25
78
19
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37
21
14
26
1.92
95673290--95673461
93
1.8
93
93
0
299
27
26
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
46
79
10
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28
26
21
23
1.99
95673883--95673942
30
2.0
30
90
0
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30
25
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1.85
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46
2.7
46
93
0
199
30
27
20
22
1.98
95681411--95681470
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
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0
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0
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1.30
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192
22
19
28
29
1.98
95684086--95684257
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1.8
93
90
2
274
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20
29
28
1.98
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2.0
19
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2.0
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0
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100
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1
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1.39
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0
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2.0
109
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1
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1
5
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1.36
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15
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45
0
2
52
1.13
95703370--95703411
15
2.9
15
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47
0
0
52
1.00
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3
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46
1.38
95703354--95703670
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2.0
157
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0
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16
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0
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38
38
0
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0
113
22
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2.0
55
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1
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50
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95713258--95713315
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30
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10
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62
10
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2.3
28
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1
0
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10
13.5
10
68
13
64
32
5
0
61
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95714044--95714092
19
2.6
18
84
12
71
28
4
0
67
1.09
95714046--95714150
30
3.5
30
77
10
106
32
3
0
63
1.12
95720117--95720334
79
2.7
79
82
7
255
24
21
27
26
1.99
95720117--95720320
40
5.1
40
84
7
254
24
22
27
25
1.99
95735939--95736073
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1.9
72
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3
182
31
16
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1.96
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4.6
47
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223
27
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1.98
95736012--95736232
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2.3
97
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302
27
18
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1.98
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0
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1.9
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0
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1.94
95740566--95740630
20
3.2
20
88
0
103
35
12
20
32
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373