Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  371  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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Score
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
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Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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21
65
66
3
1
28
1.16
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30
2.1
30
88
5
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11
4
23
1.49
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15
2.1
15
100
0
62
64
6
12
16
1.47
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2.3
141
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398
25
26
14
33
1.94
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2.0
113
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322
50
15
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28
1.68
122918561--122918598
19
2.1
18
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0
2
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48
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122918559--122918631
12
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10
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0
1
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31
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2.0
25
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0
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1.30
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2.5
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2
0
44
1.17
122927525--122927604
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1
0
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27
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13
1
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1.53
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16
2.0
17
88
5
50
54
3
6
36
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
30
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52
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1
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2.1
28
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1
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1.53
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2.5
23
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2.1
18
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0
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1.42
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2.8
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36
0
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2
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2.0
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122998437--122998901
232
2.0
222
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533
41
17
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1.77
123000628--123000704
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1.20
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20
2.7
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73
21
53
25
0
7
66
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
0
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1
33
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373