Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  251  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.97
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1.97
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22
1.99
85502002--85502223
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26
28
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.81
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Matches
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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26
27
1.99
85583733--85583915
40
4.6
40
81
8
180
25
21
26
26
2.00
85583786--85583962
40
4.5
38
79
11
151
25
21
27
25
1.99
85590518--85590592
23
3.2
23
62
23
57
32
5
32
30
1.80
85590502--85590974
47
10.1
47
92
1
698
32
9
30
27
1.89
85591093--85591171
37
2.1
37
88
0
113
24
20
31
24
1.98
85607420--85607635
94
2.3
93
83
7
249
21
28
20
28
1.98
85612972--85613142
93
1.8
93
96
0
315
29
29
20
21
1.98
85612967--85613139
46
3.7
46
81
13
228
30
28
20
21
1.98
85613562--85613620
30
2.0
29
86
3
82
32
25
3
38
1.72
85615512--85615537
11
2.4
11
100
0
52
53
19
0
26
1.45
85615996--85616059
27
2.4
27
91
0
101
29
18
14
37
1.90
85616011--85616298
27
10.7
27
81
5
248
30
10
20
38
1.86
85616040--85616298
81
3.2
80
82
6
283
30
9
20
39
1.84
85616615--85616678
28
2.3
28
83
0
83
28
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15
20
1.93
85622189--85622362
87
2.0
87
96
0
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37
20
14
27
1.92
85623102--85623136
17
2.1
17
89
5
54
45
25
8
20
1.79
85623248--85623331
28
3.0
28
80
0
96
29
21
17
30
1.96
85624755--85624818
28
2.3
28
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5
76
34
12
23
29
1.92
85628288--85628412
62
2.0
62
92
0
205
32
13
14
40
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85633497--85633533
19
1.9
19
100
0
74
27
35
10
27
1.90
85635212--85635584
186
2.0
186
98
0
728
32
21
15
31
1.94
85639977--85640023
23
2.0
23
100
0
94
29
17
8
44
1.78
85642273--85642314
17
2.4
18
80
7
52
57
2
4
35
1.33
85642986--85643055
31
2.3
31
85
9
92
44
12
11
31
1.78
85643329--85643437
53
2.1
53
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0
155
55
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11
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1.66
85653587--85653694
51
2.1
51
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3
164
42
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1.79
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2.1
26
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0
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1.69
85663064--85663184
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1.96
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22
2.3
23
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9
72
21
23
21
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1.97
85672487--85672511
13
1.9
13
100
0
50
48
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0
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17
3.0
18
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19
60
50
0
1
47
1.11
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2.7
38
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10
122
51
3
2
41
1.35
85678119--85678171
27
2.0
26
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10
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1
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2.1
30
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0
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33
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20
1.94
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250
1.9
250
93
0
826
29
20
26
24
1.99
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12.0
46
89
1
744
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13
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22
1.89
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17
2.0
17
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5
59
48
0
15
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125
2.0
124
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0
464
21
27
23
28
1.99
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23
2.0
23
81
0
54
51
26
4
17
1.65
85714638--85714742
43
2.5
43
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32
24
15
27
1.95
85718249--85718303
24
2.2
26
81
12
71
45
0
1
52
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85718441--85718535
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
85718516--85718583
16
4.2
16
96
0
118
35
36
0
27
1.58
85721735--85721962
41
5.6
41
84
3
273
21
25
17
35
1.95
85721735--85721958
81
2.8
81
82
2
272
22
25
16
35
1.95
85721733--85721962
122
1.9
122
86
1
327
21
25
16
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1.95
85728772--85728886
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2.1
55
98
0
221
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1.91
85731126--85731310
79
2.3
80
80
8
216
25
28
22
24
1.99
85731107--85731310
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5.1
40
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229
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27
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2.0
45
93
0
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20
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5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373