Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  285  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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96729738--96730047
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3.5
91
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420
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23
14
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1.91
96729738--96730047
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417
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23
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2
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6
139
22
1
34
43
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
29
29
1.98
96784919--96784967
21
2.5
19
86
6
62
36
6
0
57
1.24
96784919--96784969
19
2.5
21
84
6
70
37
7
0
54
1.29
96788503--96788529
5
5.4
5
100
0
54
59
0
0
40
0.98
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151
2.0
150
96
1
556
37
17
7
36
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2
20.0
2
100
0
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0
50
0
1.00
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25
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1.33
96821888--96821953
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19
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1.18
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30
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11
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0
19
20
1.38
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19
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3
0
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1.12
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11
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11
100
0
52
15
7
7
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1.35
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18
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17
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48
0
21
30
1.50
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269
24
21
27
26
1.99
96842654--96842872
80
2.8
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196
26
20
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1.99
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24
22
28
25
2.00
96850638--96850861
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5.7
40
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3
294
24
22
28
25
2.00
96852982--96853025
22
1.9
24
86
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45
2
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40
1.53
96858322--96858374
17
3.4
17
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20
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58
9
5
26
1.52
96858322--96858382
30
2.0
30
100
0
122
54
9
6
29
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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3
90
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28
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28
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40
4.3
40
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0
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25
29
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23
1.99
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4.3
40
88
2
222
25
27
21
25
1.99
96870485--96870707
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
96870483--96870707
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
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26
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1.99
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5.7
40
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242
25
27
21
25
1.99
96877599--96877676
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1.9
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10
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26
28
20
24
1.99
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3.7
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1
202
25
28
22
24
1.99
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5.6
39
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5
216
27
27
20
24
1.99
96894721--96894945
80
2.8
79
82
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240
27
28
20
24
1.99
96894723--96894945
120
1.9
119
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4
288
27
27
20
24
1.99
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40
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4
218
25
28
21
23
1.99
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23
1.99
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4.1
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42
0
1
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1.10
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120
1.9
120
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0
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1
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1.38
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188
42
1
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1.39
96907271--96907312
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45
0
2
52
1.13
96907262--96907303
15
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15
82
10
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47
0
0
52
1.00
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128
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1.80
96907526--96907595
16
4.4
16
94
0
104
34
34
1
30
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96911351--96911376
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2.0
13
100
0
52
0
7
0
92
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24
2.6
24
97
0
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19
12
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1.90
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2.2
24
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0
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1.43
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2.2
24
89
0
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3
9
49
1.53
96912524--96912587
24
2.7
24
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4
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10
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0
0
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3
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1.42
96917918--96918077
26
6.5
26
73
16
137
33
5
6
54
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373