Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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52
1.42
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2.2
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2.3
70
90
0
247
32
25
11
30
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
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8
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25
12
30
1.93
8012406--8012569
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70
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2
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12
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1.92
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0
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18
1.93
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2.5
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55
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9
7
1.10
8039176--8039200
13
1.9
13
100
0
50
64
0
4
32
1.12
8039525--8039610
42
2.0
42
100
0
172
36
9
11
43
1.73
8042651--8042747
40
2.6
37
81
10
124
12
13
28
45
1.80
8049739--8049857
40
3.0
40
87
0
166
15
16
26
41
1.88
8052177--8052335
43
3.7
43
81
7
180
31
26
17
24
1.97
8057807--8057866
18
3.4
17
73
13
59
48
0
28
23
1.51
8058210--8058246
9
4.1
9
89
0
56
32
10
10
45
1.74
8060810--8060859
20
2.4
21
77
12
59
36
22
4
38
1.73
8061049--8061207
43
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42
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10
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29
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1.98
8065541--8065573
17
2.0
17
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5
59
36
15
0
48
1.45
8065859--8066178
46
7.0
46
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0
444
21
24
15
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1.91
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26
2.5
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23
20
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1.96
8073948--8074003
26
2.2
26
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69
14
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21
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1.88
8096204--8096260
23
2.3
25
79
8
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50
0
7
42
1.29
8109730--8109784
25
2.3
23
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12
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43
5
16
34
1.71
8109846--8110052
25
8.4
24
67
19
79
57
4
5
32
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8109894--8109965
27
2.6
28
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8
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61
4
6
27
1.41
8109844--8110001
78
2.0
79
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1
192
58
4
6
30
1.44
8109928--8110058
23
5.6
25
73
13
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56
3
4
35
1.35
8110524--8110591
30
2.3
30
94
0
118
17
5
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25
1.68
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2.3
23
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1
0
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1.11
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1.97
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2.3
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7
110
20
25
29
23
1.99
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0
8
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1.02
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2.4
15
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0
63
16
0
5
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2.1
23
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22
0
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32
14
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1.94
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4.3
51
95
1
386
31
15
22
30
1.95
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20
2.0
20
95
0
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12
14
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1.83
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46
2.0
46
100
0
186
10
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1.90
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10
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25
2.0
25
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4
0
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1.19
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3
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17
1.9
17
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0
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1.32
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2.0
21
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45
0
5
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1.23
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24
2.1
25
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0
3
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2.0
31
90
0
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1
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1.27
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15
3.3
15
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15
50
54
0
3
41
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8178783--8178851
31
2.2
31
92
0
111
43
5
11
39
1.65
8183036--8183152
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1.9
61
91
3
191
37
1
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49
1.49
8184397--8184593
106
1.9
106
95
2
360
44
3
19
33
1.66
8184576--8184610
17
2.1
17
100
0
70
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0
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2.4
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10
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61
0
6
32
1.21
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2.7
72
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15.3
18
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0
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19
1.9
19
94
5
65
38
8
11
41
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373