Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  191  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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36
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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28
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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33
1.92
64319020--64319069
3
16.7
3
100
0
100
68
0
32
0
0.90
64320743--64320845
40
2.5
42
85
3
147
28
15
19
36
1.92
64321737--64321777
14
3.1
14
80
20
61
46
7
14
31
1.72
64322193--64322246
15
3.6
15
84
0
72
42
9
16
31
1.80
64322193--64322251
30
2.0
29
90
3
91
42
10
16
30
1.82
64329311--64329445
52
2.6
51
79
10
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28
17
24
29
1.97
64333442--64333856
47
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47
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4
596
32
8
29
29
1.86
64333454--64333801
51
7.1
51
91
5
558
32
8
28
31
1.86
64333442--64333856
98
4.3
94
87
6
596
32
8
29
29
1.86
64333454--64333845
196
2.0
196
94
0
685
31
8
29
29
1.87
64333975--64334053
37
2.1
37
88
4
115
24
18
30
26
1.98
64335531--64335660
33
3.9
33
85
0
179
23
6
39
31
1.79
64335531--64335660
66
2.0
66
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0
206
23
6
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1.79
64348729--64348766
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0
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0
0
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0.93
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24
1.9
25
86
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57
2
4
36
1.30
64356762--64356939
27
6.6
27
80
3
160
30
28
14
26
1.95
64356762--64356939
54
3.3
55
80
3
182
30
28
14
26
1.95
64364769--64364946
27
6.6
27
79
3
151
30
27
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64374773--64375168
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40
90
2
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22
20
29
27
1.98
64374773--64375168
120
3.3
120
93
1
634
22
20
29
27
1.98
64375332--64375382
25
2.0
25
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7
59
33
13
31
21
1.92
64377524--64377633
26
4.2
26
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0
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26
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0
175
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5
24
35
1.79
64398355--64398511
28
5.5
28
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29
28
19
21
1.98
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29
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109
29
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17
22
1.97
64398357--64398515
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2.8
57
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2
221
30
28
19
21
1.98
64398543--64398676
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26
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26
1.99
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46
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1.86
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1.89
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38
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26
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1.91
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19
2.2
19
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59
33
11
2
52
1.51
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2.3
60
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26
1.92
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0
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1.91
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3.2
23
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24
55
28
10
29
31
1.91
64412177--64412214
19
2.0
19
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10
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28
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23
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1.83
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22
2.0
22
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4
0
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1.21
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29
2.4
31
79
9
85
29
14
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1.76
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54
2
0
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1.14
64421147--64421188
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64421151--64421187
16
2.3
16
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59
0
0
40
0.97
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10
3.9
10
79
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44
5
2
47
1.39
64422324--64422366
21
2.1
20
86
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44
4
20
30
1.72
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11
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0
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0
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77
0.97
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40
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0
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64426832--64426975
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100
0
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0
0
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17.7
3
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8
52
31
5
1
60
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373