Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  333  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111711795--111711832
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0
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0
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.0
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3
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3.5
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23
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0
0
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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26
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3
0
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1.15
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3.0
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0
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2.0
30
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0
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29
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29
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0
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3
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19
28
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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141
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29
27
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1.96
111893835--111893877
19
2.3
19
88
8
61
20
4
4
69
1.25
111893835--111893879
20
2.3
20
88
3
65
22
4
4
68
1.25
111894146--111894255
7
15.3
7
68
16
64
44
35
0
20
1.51
111894185--111894240
28
2.0
27
86
3
76
41
39
0
19
1.52
111894219--111894254
15
2.5
15
90
4
56
44
36
0
19
1.51
111894146--111894255
22
5.1
22
70
18
79
44
35
0
20
1.51
111894415--111894458
7
6.0
7
87
10
52
34
40
0
25
1.56
111894421--111894458
15
2.5
15
91
0
58
31
42
0
26
1.56
111894615--111894658
14
3.1
14
80
0
52
45
31
2
20
1.64
111894909--111894948
20
2.0
20
85
9
55
52
5
7
35
1.51
111901146--111901406
51
5.2
51
86
1
373
32
14
22
29
1.94
111901146--111901409
101
2.6
101
94
0
447
32
14
23
29
1.94
111911112--111911172
16
4.0
15
79
10
70
45
9
1
42
1.47
111911252--111911296
16
2.8
16
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3
63
46
15
2
35
1.58
111916458--111916510
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
111921221--111921249
6
4.8
6
100
0
58
86
0
0
13
0.58
111931715--111931796
41
2.0
41
100
0
164
39
9
0
51
1.35
111931942--111931974
16
2.0
17
88
5
50
54
3
3
39
1.31
111934367--111934396
16
1.9
15
93
6
51
36
0
0
63
0.95
111936018--111936047
15
1.9
16
93
6
53
23
0
3
73
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111937340--111937364
13
1.9
13
100
0
50
24
16
0
60
1.36
111938663--111938721
30
2.0
30
96
0
109
35
22
10
32
1.87
111942070--111942242
47
3.7
46
75
12
156
24
19
31
24
1.98
111942016--111942193
94
1.9
94
82
4
225
27
19
28
24
1.98
111942843--111942887
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
111945017--111945336
46
7.0
46
92
0
489
39
15
23
22
1.91
111953969--111953999
13
2.3
13
94
5
53
0
9
0
90
0.46
111953969--111953998
11
2.7
11
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0
51
0
10
0
90
0.47
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132
2.0
132
100
0
528
31
24
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33
1.90
111975432--111975470
3
13.3
3
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15
55
28
0
0
71
0.86
111975432--111975473
13
3.1
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10
70
28
0
0
71
0.86
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43
3.4
43
77
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127
28
16
24
30
1.96
111993959--111994073
29
4.0
27
83
8
113
27
29
14
27
1.95
111998990--111999030
7
5.6
7
97
2
64
65
4
0
29
1.13
111998983--111999030
16
3.1
15
85
11
62
66
4
0
29
1.10
111999156--111999212
19
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20
73
7
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5
7
31
1.49
111999191--111999255
25
2.8
24
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6
80
52
6
7
33
1.55
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34
2.0
33
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87
57
3
4
34
1.34
111999278--111999411
25
5.6
25
70
11
84
58
2
3
35
1.31
111999265--111999309
16
2.7
18
80
13
51
60
0
2
37
1.09
111999885--112000059
30
5.8
30
89
1
228
21
4
48
26
1.68
112000837--112000876
14
2.7
16
81
18
59
65
5
15
15
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112000893--112001100
76
2.8
75
87
2
312
32
21
15
30
1.94
112001088--112001114
14
1.9
14
100
0
54
59
7
18
14
1.58
112001244--112001293
14
3.6
14
81
7
57
64
4
12
20
1.43
112001273--112001514
78
3.2
75
85
6
316
37
19
16
26
1.93
112000764--112001653
417
2.1
407
85
5
1200
36
19
16
27
1.93
112001273--112001678
71
5.3
71
76
16
318
36
18
16
28
1.92
112001395--112001747
155
2.2
156
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8
450
34
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1.93
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7
354
31
22
15
30
1.95
112002079--112002220
72
2.0
73
91
1
232
38
23
15
21
1.92
112001813--112002234
160
2.7
157
82
9
492
34
21
15
28
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          369   370   371   372   373