Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  304  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102952539--102952578
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12
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
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Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
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(0-2)
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52
1.29
103174515--103174593
35
2.2
36
77
4
88
49
5
3
41
1.43
103179230--103179349
60
2.0
60
98
0
231
23
25
18
32
1.97
103180544--103180602
27
2.2
27
100
0
118
44
0
6
49
1.29
103188778--103188826
25
2.0
25
83
0
62
42
10
18
28
1.83
103196544--103196604
30
2.0
31
87
9
90
62
3
3
31
1.27
103197107--103197133
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
103213518--103213602
45
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134
20
11
17
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1.77
103214417--103214473
16
3.6
16
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53
17
0
26
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103216645--103216866
46
4.8
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30
28
19
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1.97
103218864--103218955
47
2.0
46
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6
105
36
19
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34
1.83
103221670--103221723
20
2.7
20
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0
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24
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14
27
1.94
103223352--103223392
20
2.1
20
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4
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41
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12
31
1.83
103223483--103223586
47
2.2
47
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0
172
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22
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19
2.0
20
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1.16
103230596--103230628
6
5.5
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0
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18
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103242802--103242892
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4
21
1.20
103246127--103246163
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15
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12
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70
0
2
27
1.01
103246122--103246184
21
2.8
22
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66
1
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26
1.20
103247653--103247699
24
1.9
25
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12
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44
4
4
46
1.42
103249653--103249806
39
3.9
39
92
0
254
36
18
13
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
36
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0
103
24
10
22
41
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11
11.6
11
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4
25
1.34
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2.5
73
98
0
354
41
24
5
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1.78
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73
2.5
73
97
0
354
40
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28
1.79
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3
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3
100
0
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0
0
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23
2.3
23
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36
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7
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1.73
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23
2.3
23
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2.0
21
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38
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121
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10
41
1.78
103282356--103282442
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1.79
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101
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2.1
33
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15
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1
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1.30
103288207--103288275
32
2.1
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1.31
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2.4
29
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0
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1.09
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5
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5
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0
0
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26
1.97
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2
109
31
20
23
24
1.98
103306662--103306706
19
2.3
20
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1.50
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0
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0
6
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103309683--103309735
17
2.9
18
86
8
81
37
11
15
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103313936--103314043
26
4.2
26
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0
180
33
7
23
36
1.83
103315658--103315770
27
4.2
26
83
5
120
18
24
23
33
1.97
103315657--103315770
54
2.1
53
82
7
133
18
25
22
33
1.97
103316754--103316784
16
1.9
16
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0
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25
1.42
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0
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0
0
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0
0
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0.98
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2
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0
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24
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27
5.9
27
80
12
157
18
22
22
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373