Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  332  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111408648--111408711
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111444772--111444821
20
2.5
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64
24
8
2
66
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
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1
48
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.8
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21
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1.98
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13
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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40
6
25
27
1.81
111582161--111582232
32
2.2
32
80
9
85
40
6
25
27
1.81
111582219--111582307
44
2.0
44
86
4
124
33
7
23
34
1.84
111584431--111584480
26
1.9
26
84
8
66
36
8
0
56
1.29
111584501--111584594
26
3.6
26
81
2
98
26
5
8
59
1.48
111587554--111587619
32
2.1
32
94
0
114
15
22
7
54
1.66
111587820--111587846
12
2.2
12
100
0
54
59
33
0
7
1.25
111590832--111590937
40
2.7
40
87
0
158
50
5
34
8
1.56
111592029--111592491
46
10.0
46
93
1
660
22
24
13
39
1.90
111594622--111594671
21
2.5
20
84
9
75
46
4
0
50
1.20
111604358--111604382
12
2.1
12
100
0
50
16
28
8
48
1.74
111613545--111613718
46
3.8
46
75
15
178
22
19
28
29
1.98
111616688--111616756
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
111616679--111616758
30
2.7
30
82
7
99
11
17
15
56
1.67
111619155--111619283
46
2.8
46
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6
190
21
20
27
31
1.98
111625443--111625529
21
4.0
23
77
10
83
14
20
25
39
1.91
111626413--111626438
9
2.9
9
100
0
52
88
0
0
11
0.52
111632813--111632848
19
2.0
19
89
10
58
66
5
0
27
1.13
111633561--111633607
24
2.0
24
82
0
58
27
4
2
65
1.22
111636954--111636986
15
2.3
15
84
5
50
87
0
12
0
0.53
111639680--111639722
19
2.2
20
83
4
52
60
6
2
30
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111643378--111643428
9
5.2
9
84
11
57
25
1
1
70
1.08
111643411--111643454
10
4.4
10
83
11
54
36
0
4
59
1.18
111643456--111643493
20
2.0
20
89
5
60
34
0
10
55
1.34
111645216--111645394
79
2.3
79
91
0
286
43
12
6
37
1.70
111649945--111650094
42
3.6
42
82
1
167
29
28
18
24
1.98
111654751--111654829
7
11.0
7
86
5
68
39
0
2
58
1.12
111654763--111654822
22
2.7
22
78
0
75
33
0
3
63
1.11
111654763--111654829
14
4.6
15
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5
75
34
0
2
62
1.10
111654764--111654829
22
3.0
22
77
2
71
34
0
3
62
1.11
111654797--111654861
9
7.6
9
79
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52
32
0
3
64
1.09
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14
2.3
15
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5
50
36
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3
15
1.61
111655614--111655648
15
2.4
14
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9
52
45
31
0
22
1.53
111655672--111655711
7
5.7
7
81
0
53
47
35
0
17
1.48
111655672--111655716
14
3.2
14
90
0
72
48
31
0
20
1.49
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21
2.1
21
88
8
65
31
48
4
15
1.65
111655871--111655906
7
5.0
7
89
3
54
27
52
2
16
1.57
111655871--111655912
21
2.0
22
90
4
68
30
47
2
19
1.62
111655886--111655943
28
2.1
28
83
6
73
36
43
0
20
1.52
111661112--111661388
135
2.0
138
93
2
479
44
5
9
40
1.59
111661364--111661510
75
2.0
76
89
5
228
31
10
8
48
1.69
111671466--111671532
32
2.1
32
94
0
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22
11
19
46
1.82
111671719--111671762
3
14.7
3
90
0
70
2
0
27
70
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111674179--111674222
22
2.0
22
82
8
54
38
4
9
47
1.56
111675556--111675593
20
1.9
20
88
0
58
73
0
10
15
1.09
111680844--111680900
27
2.1
27
93
0
96
54
8
12
24
1.65
111680871--111681019
81
1.8
81
98
0
289
43
6
16
33
1.74
111684474--111684753
138
2.0
138
93
0
479
43
6
9
40
1.63
111684729--111684875
75
1.9
76
94
1
260
30
12
10
45
1.77
111690537--111690593
25
2.3
25
79
8
64
50
7
3
38
1.46
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2.0
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29
12
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1.93
111708677--111708710
17
2.1
17
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61
58
0
0
41
0.98
111711780--111711844
15
4.5
15
76
19
59
0
12
13
73
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          369   370   371   372   373