Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  372  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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28
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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34
1.08
123191711--123191761
23
2.3
22
83
10
59
29
1
9
58
1.41
123194996--123195029
4
8.5
4
100
0
68
26
0
23
50
1.50
123212674--123212743
29
2.4
29
88
6
106
47
2
8
41
1.49
123222294--123222321
6
4.7
6
100
0
56
17
0
28
53
1.44
123227356--123227405
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
123231995--123232044
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
123236567--123236592
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
123239807--123239841
16
2.1
17
89
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54
48
2
0
48
1.16
123244558--123244625
33
2.1
33
97
0
127
47
7
5
39
1.56
123245228--123245281
27
2.0
28
86
13
78
66
0
0
33
0.92
123247349--123247374
6
4.3
6
100
0
52
0
50
0
50
1.00
123264074--123264348
144
1.9
140
80
6
311
25
16
17
40
1.90
123266719--123266753
10
3.5
10
96
0
61
42
0
11
45
1.40
123266918--123266951
17
2.0
17
100
0
68
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11
0
35
1.38
123271269--123271444
82
2.2
82
90
3
284
21
6
19
52
1.68
123273832--123273887
29
1.9
29
100
0
112
33
7
5
53
1.51
123279065--123279107
22
2.0
22
81
9
52
32
2
2
62
1.20
123280097--123280174
8
10.1
8
75
18
58
62
0
0
37
0.95
123280117--123280167
15
3.3
15
80
5
57
64
0
0
35
0.94
123280139--123280215
26
3.2
25
71
8
61
61
1
1
36
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123284064--123284412
125
2.8
125
82
6
407
45
20
13
20
1.84
123287247--123287311
27
2.3
29
81
5
71
40
1
1
56
1.18
123294996--123295029
16
2.1
16
100
0
68
35
11
14
38
1.83
123298371--123298398
9
3.1
9
100
0
56
35
42
10
10
1.74
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15
2.3
15
90
5
52
29
5
0
64
1.17
123299499--123299546
3
15.7
3
95
4
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33
0
2
64
1.05
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22
2.0
22
86
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34
2
6
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14
2.3
14
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0
55
25
12
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56
1.59
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22
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1
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1.20
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16
3.3
15
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12
59
13
7
0
78
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16
3.9
16
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12
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9
0
80
0.91
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23
2.0
23
86
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63
27
13
6
51
1.67
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16
2.3
15
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5
52
31
2
2
62
1.24
123327771--123327837
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2.2
30
82
10
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5
40
1.57
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314
2.0
313
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2
1050
30
18
20
30
1.96
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2.0
22
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4
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0
38
1.20
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29
2.0
29
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0
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10
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1.70
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19
2.2
19
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13
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47
5
0
47
1.24
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23
1.9
23
85
0
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54
2
2
40
1.25
123342959--123342997
15
2.6
15
80
15
53
46
5
0
48
1.24
123348963--123349054
41
2.2
41
96
0
166
64
3
11
20
1.41
123349214--123349260
12
3.9
12
75
10
51
46
0
0
53
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123349216--123349260
24
1.9
24
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4
65
44
0
0
55
0.99
123354722--123354761
3
13.0
3
89
5
62
32
35
2
30
1.71
123387877--123387923
20
2.3
20
79
17
53
61
0
2
36
1.08
123389837--123389893
29
2.0
28
89
3
87
49
7
12
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1.67
123395087--123395122
10
3.5
10
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75
2
0
22
0.94
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3.2
16
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0
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26
1
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36
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2.0
17
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0
0
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0
0
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18
2.0
17
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52
54
0
0
45
0.99
123398452--123398486
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373