Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  368  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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16
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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18
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18
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121844345--121844375
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7
151
37
16
8
36
1.80
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59
81
10
135
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8
34
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17
2.6
17
92
0
63
53
0
2
44
1.13
121845947--121845983
17
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17
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0
0
43
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2
0
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16
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0
0
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0
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0
0
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2.0
31
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0
6
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121869751--121869815
22
2.8
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124
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1.9
19
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0
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0
2
43
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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22
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55
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22
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1.84
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27
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140
32
9
20
38
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121926293--121926426
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32
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2.6
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0
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0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373