Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
730541--730609
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16
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730541--730609
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120
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1
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2.1
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2.1
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18
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12
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12
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1.80
754253--754338
19
4.7
19
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15
74
34
12
12
39
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100
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2.4
15
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4
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2
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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17
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22
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13
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13
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782755--782870
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2.3
51
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12
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30
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1.62
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0
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20
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250
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0
0
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2.0
22
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0
0
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2.3
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2.2
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2.0
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75
45
11
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1.67
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2.3
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14
71
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10
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2.0
15
100
0
60
26
6
6
60
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
19
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0
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51
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47
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50
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4
6
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16
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14
52
1.69
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27
2.5
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26
7
11
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2.1
26
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2.0
240
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231
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1.93
848880--849103
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0
367
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2.1
19
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13
55
55
12
7
25
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
879237--879480
132
1.8
132
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0
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30
1.65
904401--904657
131
2.0
131
89
0
397
26
17
19
35
1.94
905628--905655
13
2.2
13
100
0
56
25
28
7
39
1.82
908141--908297
51
3.1
50
89
1
242
31
14
23
29
1.94
913851--914019
60
2.9
60
86
10
242
43
19
4
32
1.72
915256--915288
12
2.7
13
81
18
52
81
6
12
0
0.85
915257--915298
11
3.7
11
90
9
59
83
4
9
2
0.88
915254--915334
41
2.0
38
81
13
92
81
6
8
3
0.97
915308--915336
14
2.0
15
93
6
51
75
13
3
6
1.13
915745--915789
10
4.7
9
84
13
54
80
0
13
6
0.91
915745--915799
20
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19
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12
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0
14
5
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915754--915799
17
2.8
17
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6
60
80
0
15
4
0.86
916812--916871
30
1.9
32
83
6
79
20
20
26
33
1.97
916895--917355
134
3.5
134
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3
792
27
20
23
29
1.99
921739--921769
15
2.1
15
100
0
62
22
12
25
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
2.1
20
90
0
66
40
11
16
30
1.85
924935--924965
15
2.1
15
100
0
62
22
12
25
38
1.90
928548--928585
19
2.0
19
100
0
76
15
15
15
52
1.75
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22
1.9
22
95
0
75
47
0
4
47
1.23
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15
2.1
15
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0
62
48
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19
1.72
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28
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45
2.0
45
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0
139
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1.88
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3.7
108
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1.88
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2.0
45
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6
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29
1.91
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2.0
45
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0
148
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29
1.91
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3.7
57
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1
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32
10
28
28
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0
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17
0
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303
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28
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2.3
105
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2
273
32
13
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26
1.93
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2.1
15
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0
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10
0
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5.2
227
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1575
35
14
15
34
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2.6
22
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2
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15
6
15
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1.53
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3.3
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0
51
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0
0
63
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14
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14
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0
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12
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0
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1.34
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13.0
3
100
0
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0
33
0
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141
2.5
141
91
5
554
32
16
18
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
984440--984464
3
8.3
3
100
0
50
32
0
68
0
0.90
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2.1
93
80
3
213
27
18
26
27
1.98
994958--995189
75
3.1
75
89
1
322
30
22
26
21
1.99
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18
2.2
18
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0
51
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17
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19
0
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2.9
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24
0
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1
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18
21
26
1.96
1006248--1006798
250
2.2
251
90
1
847
33
18
21
26
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373