Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
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Copy
Number
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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12
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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11
4.8
12
89
10
80
16
7
7
69
1.35
17579774--17579837
23
2.9
23
88
4
87
14
7
7
70
1.33
17579775--17579837
12
5.7
11
83
10
76
14
7
7
69
1.34
17579774--17579836
11
5.6
11
81
10
65
14
6
7
71
1.29
17585115--17585139
13
1.9
13
100
0
50
36
16
32
16
1.90
17587271--17587356
30
2.9
30
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10
90
15
19
0
65
1.28
17588205--17588275
30
2.5
28
81
6
79
11
14
5
69
1.36
17588225--17588263
17
2.4
17
86
4
53
7
12
7
71
1.29
17588241--17588293
14
4.1
12
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15
9
3
71
1.26
17588267--17588318
14
3.5
14
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19
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17
5
3
73
1.19
17588239--17588329
43
2.2
41
81
16
109
14
7
4
73
1.21
17589175--17589324
27
5.5
27
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4
176
29
27
15
28
1.96
17589870--17589894
13
1.9
13
100
0
50
32
16
20
32
1.94
17597178--17597356
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27
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29
27
15
27
1.96
17597902--17597926
13
1.9
13
100
0
50
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20
32
1.94
17598668--17598714
24
2.0
24
84
12
62
12
17
0
70
1.17
17601931--17602026
28
3.4
28
76
0
84
26
26
17
30
1.97
17611251--17611299
9
5.4
9
85
9
73
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17614629--17614677
20
2.5
19
80
6
62
38
2
8
51
1.43
17614794--17614836
19
2.3
19
79
0
50
34
11
13
39
1.82
17614802--17614838
19
1.9
19
88
0
56
32
8
18
40
1.80
17620678--17620715
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
17620944--17621065
46
2.7
46
93
0
199
29
27
21
21
1.98
17620942--17621084
46
3.1
45
84
6
137
29
27
20
21
1.98
17621488--17621547
30
2.0
30
86
0
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5
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1.78
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2.0
28
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0
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26
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1.92
17636794--17636827
7
4.9
7
100
0
68
58
0
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1.36
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7
157
28
16
23
30
1.96
17638877--17638959
25
3.3
25
75
0
85
36
18
25
20
1.95
17638886--17638981
50
1.9
50
83
8
124
37
15
26
20
1.93
17643434--17643531
41
2.4
41
92
0
169
28
28
22
20
1.98
17649398--17649677
110
2.6
110
89
2
422
61
13
0
24
1.36
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110
3.0
110
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5
290
61
13
0
24
1.34
17653787--17653903
46
2.6
46
89
8
170
25
28
17
28
1.98
17653824--17653997
46
3.8
45
77
11
147
22
29
20
27
1.99
17660030--17660062
13
2.5
13
100
0
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6
30
45
18
1.73
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4.5
46
78
10
205
24
29
17
28
1.97
17681387--17681621
94
2.5
92
81
10
255
24
29
17
28
1.97
17689037--17689256
47
4.7
46
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9
225
24
28
17
29
1.97
17689041--17689298
46
5.5
46
77
7
211
24
28
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17689041--17689301
94
2.8
92
83
6
260
24
28
18
28
1.98
17689041--17689298
140
1.8
140
83
6
344
24
28
18
29
1.98
17700770--17700906
60
2.3
59
85
8
170
28
20
25
25
1.99
17701546--17701578
18
1.9
17
88
11
50
42
12
15
30
1.83
17702857--17702908
26
2.1
24
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77
19
1
9
69
1.26
17702929--17702991
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2.8
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4
4
58
1.39
17708527--17708552
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2.0
13
100
0
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0
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5
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0
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17721809--17721842
15
2.3
15
89
0
50
70
5
0
23
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          369   370   371   372   373