Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  342  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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61
1.34
114606470--114606515
16
2.8
16
84
15
67
54
0
0
45
0.99
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1.9
49
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12
120
46
1
31
20
1.58
114611485--114611666
46
4.0
46
89
1
249
42
14
21
21
1.88
114614202--114614396
104
1.9
105
85
1
275
31
25
12
30
1.92
114614202--114614396
35
5.6
35
82
2
232
31
25
12
30
1.92
114615118--114615168
5
10.4
5
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4
95
41
0
0
58
0.98
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15
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15
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35
0
12
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23
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6
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15
19
24
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114622057--114622208
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3.2
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5
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15
25
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5.2
53
77
12
220
31
26
16
26
1.96
114622175--114622387
53
4.0
53
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2
286
30
27
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25
1.97
114622175--114622387
107
2.0
104
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4
284
30
27
16
25
1.97
114624122--114624174
20
2.6
21
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11
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33
0
7
58
1.26
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11
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0
0
76
0.78
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1.9
82
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1
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28
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11
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2.1
19
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1.58
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2.0
48
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0
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14
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33
2.4
33
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17
15
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150
3.5
149
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808
29
6
6
57
1.50
114638254--114638327
16
4.6
16
75
9
78
20
5
2
71
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114638254--114638337
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5.1
16
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5
2
70
1.20
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12
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0
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22
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23
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9
9
52
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114641535--114641710
3
59.7
3
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4
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27
7
2
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1.38
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24
5.6
24
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27
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2
61
1.38
114641566--114641680
27
4.4
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139
28
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1
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1.36
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3.0
51
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2
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2.0
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100
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0
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0
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0
107
17
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20
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0
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0
260
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0
0
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50
1.00
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35
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18
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35
1.96
114675097--114675236
54
2.6
55
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2
194
18
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177
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24
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1.76
114682062--114682137
26
2.8
26
84
4
71
31
22
15
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114682073--114682137
26
2.4
26
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5
85
27
24
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29
1.98
114682240--114682379
27
5.2
27
88
2
183
17
24
22
35
1.95
114682441--114682480
19
2.0
22
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2
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32
1.61
114688912--114689019
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2.0
55
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139
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1
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2.4
45
84
7
128
20
16
19
42
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373