Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  339  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
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Copy
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Score
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Indices
Period
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Copy
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Indices
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A
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22
1.94
113597299--113597328
13
2.3
13
94
0
51
53
6
0
40
1.27
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13
1.9
13
100
0
50
32
4
24
40
1.73
113601672--113601799
44
3.0
43
79
6
150
22
16
28
32
1.96
113601991--113602036
14
3.4
14
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11
60
34
10
15
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26
2.0
26
100
0
106
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11
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27
1.9
27
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1
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113615090--113615244
39
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47
3
20
29
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113627819--113627871
3
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3
84
7
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1
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30
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14
2.0
14
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0
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0
0
28
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2.1
23
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0
8
26
1.20
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10
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0
0
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16
2.1
17
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5
54
28
0
2
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1.04
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21
2.2
21
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25
0
2
72
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14
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2.1
13
100
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0
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1.64
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2.0
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0
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2
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0
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0
0
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4
22
2
1.18
113671939--113672012
31
2.4
32
82
13
93
25
29
29
14
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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2.0
20
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22
0
32
1.53
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2.0
21
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0
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2
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1.64
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17
2.3
16
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0
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64
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3
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0
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0
0
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0
0
60
0.97
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10
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7
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0
0
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0
0
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2.5
28
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11
81
21
4
0
74
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113739138--113739202
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12
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0
80
0.85
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3.1
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2
0
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5
0
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1.01
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6
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20
5
0
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0
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35
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0
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12
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60
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0
73
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373