Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  350  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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2
44
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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60
36
4
2
57
1.32
116792793--116792857
25
2.8
24
88
6
89
35
7
4
52
1.51
116793010--116793049
8
5.3
7
88
8
53
32
0
2
65
1.06
116793010--116793053
23
1.9
23
86
9
63
31
0
2
65
1.05
116792971--116793049
15
5.1
15
75
20
65
30
2
1
65
1.13
116792971--116793053
8
10.5
8
72
19
50
30
2
1
66
1.12
116801370--116801619
73
3.4
73
90
0
367
29
16
23
31
1.96
116801861--116801888
14
2.0
14
100
0
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21
7
57
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116801717--116801969
91
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29
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20
32
1.96
116801875--116802180
72
4.0
76
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370
31
15
19
34
1.93
116802451--116802675
73
3.1
72
80
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238
29
15
22
32
1.95
116802447--116802646
73
2.8
71
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4
240
30
14
22
33
1.93
116802666--116802700
14
2.5
14
90
0
52
17
11
8
62
1.52
116802699--116802883
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74
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1
282
30
16
21
31
1.95
116802520--116802848
162
2.0
159
86
6
448
27
15
21
35
1.94
116803553--116803662
30
3.7
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0
193
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3
23
1.67
116803553--116803768
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3.4
60
82
13
270
24
48
3
23
1.67
116803618--116803703
41
2.1
41
100
0
172
22
47
2
27
1.63
116803595--116803768
71
2.6
71
86
9
235
23
48
3
24
1.66
116803666--116803768
30
3.4
30
90
0
170
24
49
3
22
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116803558--116803763
101
2.0
101
97
0
385
23
49
3
24
1.66
116803954--116803986
18
1.9
17
88
11
50
21
6
33
39
1.78
116804329--116804400
25
2.9
24
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12
74
36
4
0
59
1.17
116804414--116804478
25
2.8
24
88
6
89
36
6
4
52
1.47
116804634--116804676
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2.7
15
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7
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32
0
2
65
1.06
116804634--116804680
8
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8
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60
31
0
2
65
1.04
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3.0
12
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0
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27
1.77
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0
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1.27
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2.6
23
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10
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3
1
42
52
1.28
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20
2.0
20
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1.67
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2.2
26
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0
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5
24
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1.78
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26
2.0
26
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7
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37
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15
23
1.93
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2.5
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226
28
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23
34
1.94
116827203--116827355
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2.1
71
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2
225
23
15
22
38
1.92
116827288--116827775
140
3.5
140
97
1
906
24
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21
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1.93
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13
2.5
13
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4
50
20
11
8
58
1.59
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72
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29
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19
34
1.94
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2.0
49
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0
183
30
16
20
32
1.95
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121
2.0
121
94
0
426
30
16
18
34
1.93
116827920--116828273
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473
31
17
19
32
1.95
116828195--116828366
93
1.8
93
85
2
238
27
20
19
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116828267--116828859
88
7.2
76
72
18
363
27
17
18
36
1.93
116828047--116828859
252
3.3
241
84
6
930
28
17
19
34
1.94
116828630--116828691
30
2.1
30
90
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99
19
9
29
41
1.83
116839612--116840028
136
3.0
134
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466
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12
9
38
1.77
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289
2.4
291
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759
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12
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38
1.74
116851179--116851299
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4.2
28
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6
131
19
4
49
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0
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20
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20
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11.9
72
75
14
576
33
20
17
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373