Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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88
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13
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40
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20
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0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
20
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2.0
122
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337
22
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32
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6556549--6556794
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23
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32
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47
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1.98
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2.0
29
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1
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27
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2.0
41
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9
96
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28
12
23
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
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176
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28
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21
1.99
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1.8
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281
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29
22
21
1.99
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2.0
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30
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29
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18
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1.96
6598641--6598799
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19
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1.95
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6606121--6606254
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213
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6614474--6614581
44
2.4
44
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144
30
15
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6614553--6615268
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205
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1
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28
1.97
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19
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19
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5
231
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11
16
35
1.84
6615645--6615780
55
2.4
56
95
4
238
37
11
16
35
1.84
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7
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0
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0
0
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1.13
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12
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13
53
58
0
7
33
1.25
6619723--6619825
23
4.4
23
70
21
81
63
0
3
33
1.13
6622644--6623009
182
2.0
182
98
1
707
26
20
12
41
1.87
6631262--6631380
61
1.9
64
84
5
163
36
12
10
39
1.79
6631912--6631936
6
4.2
6
100
0
50
0
16
0
84
0.63
6631990--6632015
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
6635500--6635546
24
1.9
25
91
4
78
59
4
4
31
1.36
6635802--6635848
24
2.0
23
87
4
67
48
6
17
27
1.71
6636830--6636859
7
4.3
7
91
0
51
16
0
3
80
0.85
6641349--6641422
37
2.0
37
100
0
148
54
8
13
24
1.66
6644170--6644214
21
2.1
21
100
0
90
42
20
4
33
1.72
6646270--6647086
162
5.0
162
92
0
1303
26
20
16
36
1.93
6648954--6649465
162
3.1
162
89
1
801
27
18
16
38
1.92
6655845--6655870
8
3.2
8
100
0
52
76
11
0
11
1.01
6656386--6656427
17
2.6
16
82
14
50
40
2
0
57
1.12
6656347--6656511
82
2.0
81
81
9
194
48
0
3
47
1.21
6658345--6658631
148
1.9
148
92
1
477
27
17
16
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6659785--6660186
165
2.5
162
83
1
498
28
18
17
35
1.93
6661228--6661289
26
2.3
27
78
13
67
66
0
8
25
1.19
6661192--6661301
34
3.1
35
71
20
86
63
1
9
25
1.34
6662381--6662406
13
2.0
13
100
0
52
7
0
30
61
1.24
6663137--6663316
73
2.5
71
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7
249
35
23
16
23
1.95
6663021--6663261
127
1.9
128
84
5
326
36
18
17
27
1.93
6663334--6663730
69
5.6
69
83
12
446
32
19
16
30
1.95
6663210--6663452
124
2.0
125
87
6
354
37
20
16
25
1.93
6663344--6663735
145
2.7
143
86
9
557
33
18
17
30
1.94
6663742--6663915
70
2.5
69
86
5
219
33
22
14
29
1.93
6663004--6663915
197
4.6
195
80
11
803
34
20
16
28
1.94
6677075--6677110
16
2.3
16
90
4
56
13
2
2
80
0.93
6678688--6678746
21
3.0
21
69
16
54
62
1
0
35
1.05
6679295--6679335
21
2.0
21
95
0
73
48
0
9
41
1.36
6679483--6679523
20
2.1
20
86
4
57
43
0
2
53
1.13
6679567--6679609
17
2.4
18
80
3
52
27
2
6
62
1.33
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90
2.3
90
82
5
244
29
22
13
34
1.93
6690130--6690185
29
1.9
30
85
10
80
64
1
1
32
1.14
6690244--6690309
33
2.0
33
91
5
107
33
13
12
40
1.82
6690694--6690770
33
2.3
33
93
0
127
36
16
16
29
1.92
6701216--6701292
39
2.0
39
95
5
140
41
0
15
42
1.47
6711738--6711857
30
4.0
30
81
4
143
16
51
10
21
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6711800--6711884
42
2.0
42
86
0
116
16
52
9
21
1.71
6711788--6711929
72
2.0
72
87
0
203
17
52
9
19
1.72
6711839--6711967
30
4.2
30
79
6
118
20
51
8
20
1.73
6711904--6711968
33
2.0
33
90
0
103
21
47
6
24
1.73
6711869--6712676
72
11.4
72
71
12
303
17
52
9
20
1.72
6712082--6712175
30
3.1
30
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3
109
22
53
6
18
1.67
6712130--6712213
33
2.5
33
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0
105
22
51
4
21
1.66
6712205--6712239
18
1.9
18
88
0
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22
1.72
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63
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0
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18
54
9
18
1.69
6712220--6712448
30
7.1
32
71
11
148
18
54
8
17
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373