Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  370  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122363393--122363709
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0
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1.8
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50
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2
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49
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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179
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2.0
30
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1
38
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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21
1.08
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1.99
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175
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5
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28
22
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122540723--122540858
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2.0
20
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55
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17
2
1.55
122542965--122543023
3
19.7
3
82
6
75
30
5
1
62
1.26
122543152--122543231
36
2.2
36
80
8
92
36
8
2
52
1.46
122545516--122545559
19
2.3
20
84
7
56
27
22
11
38
1.88
122549870--122550445
88
6.6
87
87
3
718
29
22
23
25
1.99
122549874--122550445
175
3.3
175
90
4
822
29
22
23
25
1.99
122550282--122550417
43
3.2
43
62
12
107
33
23
19
23
1.97
122551567--122551606
20
2.0
20
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9
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55
25
17
2
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122552525--122552580
3
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30
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1.28
122554532--122554658
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2.0
63
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1.78
122555126--122555195
5
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5
96
0
131
18
0
21
60
1.37
122555678--122555715
11
3.1
12
79
20
51
42
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18
1.89
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15
2.9
15
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10
61
48
0
0
51
1.00
122567758--122567799
20
2.2
19
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57
66
2
2
28
1.16
122569207--122569248
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0
0
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40
3.8
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7
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37
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21
22
1.95
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20
30
29
1.97
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22
2.1
22
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0
56
28
0
28
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1.55
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14
2.9
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29
0
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39
1.57
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22
2.9
22
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74
19
0
42
38
1.51
122571152--122571194
11
3.8
12
78
9
54
30
0
0
69
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
24
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37
0
0
62
0.95
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14
4.3
14
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1
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37
1.67
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5.7
43
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1
260
26
16
29
27
1.97
122575996--122576229
85
2.7
86
80
3
249
26
15
29
28
1.96
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22
2.0
22
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0
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25
20
11
1.86
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23
2.1
23
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0
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2
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1.32
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0
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0
0
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50
0
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24
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2.5
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19
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0
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0
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2.0
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17
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23
20
29
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2.2
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88
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418
28
23
18
29
1.98
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3.3
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327
27
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19
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1.98
122625530--122625826
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3.4
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321
26
23
19
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1.98
122625449--122625874
174
2.4
174
96
0
789
26
23
20
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122643338--122643380
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58
0
4
37
1.19
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
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29
2.2
29
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8
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40
9
8
41
1.67
122655039--122655098
22
2.8
21
85
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35
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50
1.59
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0
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100
0
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1.9
31
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84
32
0
16
50
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373