Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.4
25
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2.4
236
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73
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3.0
75
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5.2
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1.95
5452168--5452260
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15
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1.95
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1
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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24
17
28
1.97
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13.9
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8
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24
17
28
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2.0
134
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658
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5480201--5482580
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10.3
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1
60
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5491374--5491422
21
2.3
20
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10
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36
2
0
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1.08
5491394--5491422
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2.0
15
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0
0
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0
0
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18
2.4
18
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64
2
9
23
1.35
5514188--5514240
14
3.7
15
78
14
58
41
3
15
39
1.65
5514200--5514242
14
3.0
14
86
3
59
41
2
18
37
1.63
5514699--5514784
22
4.0
22
72
13
88
44
22
5
27
1.75
5515729--5515789
32
1.9
32
93
0
104
49
18
4
27
1.68
5515729--5515802
32
2.5
30
85
10
91
50
18
4
27
1.65
5522917--5522972
28
2.0
29
86
6
80
32
12
1
53
1.49
5539122--5539198
38
2.0
38
92
0
127
36
9
23
31
1.86
5541513--5541566
21
2.6
21
80
11
74
38
33
7
20
1.80
5544550--5544604
28
1.9
28
85
3
74
32
0
5
61
1.19
5549541--5549613
36
2.0
36
91
0
119
26
13
26
34
1.93
5561244--5561291
19
2.6
18
87
9
69
70
0
12
16
1.16
5562182--5562229
15
3.1
16
83
16
57
70
2
0
27
0.98
5562174--5562243
11
6.5
11
76
12
56
65
2
1
30
1.15
5566436--5566483
19
2.6
18
87
9
69
70
0
12
16
1.16
5567350--5567397
15
3.1
16
83
16
57
70
2
0
27
0.98
5567341--5567411
11
6.5
11
76
12
58
66
2
1
29
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5569703--5569762
14
4.2
14
75
16
61
63
1
1
33
1.14
5569841--5569890
13
3.5
15
83
8
52
52
2
2
44
1.24
5576103--5576148
14
3.2
14
78
3
56
52
0
2
45
1.13
5576103--5576156
28
1.9
28
85
7
74
53
1
1
42
1.22
5576197--5576228
14
2.3
14
94
0
55
31
0
0
68
0.90
5577141--5577180
14
2.9
13
89
10
62
60
0
5
35
1.19
5577212--5577239
8
3.5
8
100
0
56
21
0
0
78
0.75
5577212--5577247
16
2.2
16
90
0
54
25
2
0
72
0.98
5585438--5585551
51
2.2
51
92
0
183
32
14
23
28
1.95
5586605--5586632
13
2.2
13
100
0
56
60
0
0
39
0.97
5589738--5589792
22
2.5
21
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8
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43
0
0
56
0.99
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14
3.0
14
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20
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43
2
0
54
1.12
5607374--5607414
22
1.9
22
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5
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56
2
2
39
1.26
5609152--5609201
23
2.1
23
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17
59
42
20
10
28
1.84
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12
2.1
12
100
0
50
76
8
0
16
1.02
5615929--5615999
21
3.5
21
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14
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32
5
0
61
1.19
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20
2.8
20
80
2
76
76
0
21
1
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23
2.0
22
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4
61
72
0
25
2
0.96
5624050--5624104
9
5.8
9
77
10
56
76
0
21
1
0.88
5631828--5631891
32
2.0
32
96
0
119
45
15
9
29
1.78
5638648--5638693
20
2.3
20
81
3
58
43
0
4
52
1.21
5655662--5655936
46
6.0
46
90
1
390
22
24
14
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5658072--5658123
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
5663303--5663344
18
2.3
18
87
0
57
33
28
7
30
1.84
5666444--5666476
17
1.9
17
93
0
57
27
21
3
48
1.64
5666576--5666611
13
2.8
14
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16
51
27
25
0
47
1.52
5666563--5666603
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
5666764--5666871
21
5.0
22
83
5
114
36
24
23
16
1.94
5666764--5666872
42
2.5
42
82
2
137
35
23
22
17
1.95
5667235--5667276
2
21.5
2
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77
50
0
0
50
1.00
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15
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1.51
5668014--5668050
6
6.2
6
87
12
58
0
16
0
83
0.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373