Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87772255--87772437
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1.95
87794591--87794771
82
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21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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80
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21
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25
1.99
87868893--87869115
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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2.0
22
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65
31
2
28
37
1.69
88052104--88053007
300
3.0
300
97
0
1691
26
7
23
42
1.80
88053638--88053680
19
2.2
20
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4
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6
4
25
1.40
88056331--88056365
14
2.5
15
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13
56
20
14
17
48
1.81
88062961--88063000
17
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4
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0
43
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23
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14
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0
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4
1
41
1.30
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1.96
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29
1.86
88122044--88122490
47
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47
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29
1.86
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1.98
88130955--88131296
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47
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0
540
34
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28
1.87
88131029--88131104
25
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25
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30
1.80
88133242--88133354
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38
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17
27
23
1.97
88133412--88133521
39
2.8
40
95
2
204
20
24
30
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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11
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1.91
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1.96
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2.3
56
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0
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18
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1.97
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34
2.0
34
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1.97
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1.79
88178542--88178753
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7
182
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16
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1.80
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41
2.0
41
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0
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1.97
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1.9
411
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0
1517
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1.94
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22
2.4
22
81
9
63
24
22
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1.95
88179664--88179711
22
2.2
22
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7
62
27
27
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1.97
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1.9
140
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0
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1.98
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2.7
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10
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28
25
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28
1.98
88202697--88202734
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2.0
20
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0
36
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1.8
93
96
0
311
29
28
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88202955--88203130
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3.8
46
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28
19
21
1.98
88210995--88211165
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.99
88210987--88211162
46
3.8
46
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12
198
29
27
21
21
1.98
88211588--88211644
30
1.9
30
88
0
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29
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2.0
20
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1.57
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0
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0
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2.0
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0
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1.98
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1.99
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1.9
90
90
6
268
27
30
20
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373