Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
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Period
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A
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37
1.38
1542753--1542819
19
3.2
21
75
23
61
58
0
4
37
1.19
1542791--1542832
12
3.4
12
81
15
50
61
2
0
35
1.09
1542783--1542832
21
2.4
21
80
16
59
60
2
0
38
1.09
1542916--1542944
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
1544723--1544762
19
2.1
19
85
0
53
67
10
10
12
1.42
1548950--1549004
28
2.0
28
85
7
76
69
0
0
30
0.89
1548996--1549022
8
3.4
8
100
0
54
48
0
0
51
1.00
1552478--1552502
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
1554440--1554474
16
2.2
16
89
0
52
71
0
0
28
0.86
1554593--1554655
31
2.0
31
87
0
90
36
14
17
31
1.90
1558137--1558175
21
1.9
20
89
5
60
64
10
2
23
1.37
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24
1.9
26
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16
66
58
6
0
35
1.23
1558704--1558733
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
1559168--1559213
20
2.2
21
84
7
58
58
0
39
2
1.10
1559307--1559345
12
3.3
12
82
7
53
23
0
2
74
0.94
1560686--1561208
54
9.7
54
94
0
895
37
19
15
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1561172--1561388
87
2.5
86
90
4
330
33
20
17
28
1.96
1561308--1561627
75
4.1
75
71
13
277
33
19
16
30
1.94
1561219--1561729
162
3.1
160
87
4
684
35
18
16
29
1.93
1561386--1561814
87
5.0
88
69
14
299
36
18
15
29
1.92
1561545--1561798
88
2.8
89
85
4
341
36
19
14
28
1.92
1561712--1561744
15
2.2
15
94
0
57
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6
9
18
1.40
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2.0
32
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3
90
45
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9
35
1.70
1582911--1582970
30
2.0
29
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3
84
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10
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40
1.69
1582911--1582990
29
2.7
29
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7
81
43
8
7
40
1.64
1585848--1585872
3
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100
0
50
36
0
32
32
1.58
1586183--1586211
13
2.1
14
93
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51
17
0
0
82
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2.0
46
97
0
171
43
40
11
5
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28
2.7
23
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17
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36
10
3
49
1.53
1606603--1606631
5
6.0
5
96
4
51
20
0
0
79
0.74
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28
2.7
23
75
17
60
36
10
3
49
1.53
1622375--1622457
43
2.0
42
95
2
148
45
15
7
31
1.73
1626021--1626063
18
2.4
18
88
11
70
46
13
2
37
1.57
1629028--1629058
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
1629604--1629696
18
5.2
18
88
0
141
29
24
15
31
1.95
1633749--1633779
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
1637109--1637192
24
3.2
26
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15
82
36
30
11
20
1.89
1637100--1637203
53
2.0
53
100
0
208
33
29
11
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1637100--1637186
29
3.2
29
68
15
94
34
31
10
24
1.89
1637679--1637718
19
2.2
18
90
4
62
42
17
2
37
1.63
1641343--1641435
43
2.2
44
94
3
163
52
12
5
29
1.61
1641457--1641496
19
2.2
18
86
4
53
42
15
2
40
1.60
1647534--1647897
96
3.8
95
79
3
345
31
34
23
11
1.90
1647492--1647875
144
2.7
142
78
8
339
30
34
22
12
1.91
1647495--1647937
48
9.2
48
80
2
298
30
33
22
12
1.92
1648073--1648167
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2.4
39
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3
111
41
33
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6
1.76
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3.2
48
79
0
137
28
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14
1.93
1648477--1648569
48
1.9
48
84
4
125
32
38
18
10
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          369   370   371   372   373