Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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13
36
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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1.79
10768934--10769093
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78
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259
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1.79
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5
27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
193
34
17
16
31
1.93
10813700--10814160
127
3.6
127
97
0
863
34
21
16
28
1.94
10827105--10827167
3
21.0
3
96
0
108
63
0
3
33
1.10
10827739--10827763
8
3.1
8
100
0
50
12
0
0
88
0.53
10828333--10828366
17
2.0
17
94
0
59
8
0
38
52
1.33
10828974--10829015
14
3.2
13
87
12
59
76
0
23
0
0.79
10831096--10831120
12
2.1
12
100
0
50
56
16
8
20
1.65
10837200--10837244
24
1.9
23
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13
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40
20
0
40
1.52
10837652--10837704
23
2.3
24
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6
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39
11
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1.64
10837732--10837760
13
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14
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20
3
0
75
0.94
10843355--10843400
23
2.0
23
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58
39
13
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1.63
10843424--10843452
13
2.1
14
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20
3
0
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2.0
23
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4
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0
0
56
0.99
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9
4.3
9
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18
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73
0
0
26
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71
0
0
28
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2.0
24
100
0
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16
0
48
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10866600--10866624
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12
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0
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0
8
0
0.40
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2.5
24
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15
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1
0
41
1.09
10869004--10869993
2
512.5
2
73
8
492
37
1
57
3
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10870312--10870376
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2.1
31
91
5
105
49
10
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33
1.63
10872378--10872454
36
2.1
36
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0
145
50
9
18
22
1.74
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20
2.3
20
85
7
58
45
17
13
23
1.83
10875424--10875464
19
2.1
19
86
9
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53
2
19
24
1.57
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24
2.0
24
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20
20
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1.95
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25
2.0
25
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22
22
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1.94
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1.96
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23
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20
1.96
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23
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16
1.87
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35
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22
25
1.94
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2.4
90
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235
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21
24
1.93
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2
184
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16
21
26
1.94
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127
44
16
20
17
1.87
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2.2
42
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0
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5.7
46
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1
366
42
14
23
19
1.88
10898807--10899076
92
2.9
92
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2
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41
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22
20
1.89
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138
2.0
139
88
2
408
41
14
22
20
1.89
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3.0
52
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25
16
27
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11
145
26
16
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26
1.97
10912635--10912868
115
2.0
115
89
0
351
30
25
10
32
1.90
10912926--10913006
41
2.0
41
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0
144
43
14
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1.87
10914024--10914060
11
3.4
11
88
0
56
78
8
5
8
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10914013--10914062
22
2.3
22
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0
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10
4
10
1.15
10914077--10914101
5
5.0
5
100
0
50
0
0
60
40
0.97
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2.0
23
100
0
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17
21
1.71
10922999--10923042
20
2.4
18
88
11
63
0
34
0
65
0.93
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18
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1.04
10930005--10930067
18
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1
38
1.54
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2.1
35
100
0
144
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2
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22
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52
17
5
2
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1.14
10938519--10938560
21
2.0
21
90
9
68
23
9
28
38
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373