Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  254  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
86273217--86273764
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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2.5
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10
24
21
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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29
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1.95
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202
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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89
1
283
26
18
25
29
1.98
86413961--86414177
46
4.7
44
75
13
170
21
28
21
29
1.99
86413910--86414178
94
2.9
91
76
13
260
22
27
20
28
1.99
86417340--86417397
29
2.1
27
87
6
80
62
15
3
18
1.47
86418290--86418346
23
2.5
23
88
0
78
19
10
8
61
1.54
86421294--86421352
9
6.8
9
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50
84
1
6
6
0.83
86422890--86422919
15
2.0
15
93
0
51
70
10
0
20
1.16
86422957--86422995
18
2.2
18
86
9
53
66
0
5
28
1.12
86422998--86423090
29
3.2
28
77
17
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3
3
31
1.27
86430362--86430397
19
1.9
19
88
5
56
75
0
19
5
1.00
86431120--86431171
22
2.5
20
87
6
68
19
0
1
78
0.84
86433029--86433058
14
2.1
14
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0
51
43
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16
1.74
86433725--86433800
37
2.1
36
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11
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53
2
1
42
1.23
86439792--86439906
42
2.7
42
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2
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31
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29
1.95
86446060--86446097
9
4.1
9
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58
23
0
39
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1.55
86446060--86446097
19
2.1
19
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5
60
23
0
39
36
1.55
86447887--86447940
22
2.5
21
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3
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18
38
29
12
1.88
86452237--86452284
19
2.6
18
90
9
78
72
0
10
16
1.10
86453173--86453220
15
3.1
16
83
16
57
70
2
0
27
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86453164--86453234
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11
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12
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2
1
29
1.15
86456698--86456739
16
2.7
15
82
10
57
7
14
4
73
1.21
86457261--86457298
7
5.4
7
96
0
67
0
44
10
44
1.38
86461192--86461550
185
1.9
185
93
1
621
35
17
26
20
1.95
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12
2.8
12
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0
50
50
17
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1.74
86468620--86468797
27
6.6
27
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3
205
29
28
15
26
1.96
86468641--86468796
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1.9
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233
29
28
15
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1.96
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5.6
46
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1.88
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2.1
42
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155
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14
17
34
1.90
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11
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11
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37
0
1
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1.07
86487697--86487760
34
1.9
34
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3
85
37
1
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57
1.24
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14
2.9
13
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73
0
0
26
0.83
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12
5.4
12
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53
28
4
3
63
1.29
86489875--86489913
18
2.2
18
85
0
51
33
2
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1.41
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2.2
23
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17
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29
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53
1.61
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19
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20
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60
0
1
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1.07
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38
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56
0
2
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1.11
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22
2.0
22
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72
0
6
20
1.07
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4.2
12
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0
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0.88
86492360--86492421
25
2.4
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10
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74
0
4
20
1.00
86492637--86492704
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16
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0
109
29
0
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35
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86492644--86492708
32
2.0
32
96
0
121
32
0
35
32
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86492685--86492794
45
2.6
41
78
9
116
32
5
29
32
1.80
86492916--86492970
25
2.2
25
84
9
69
52
1
0
45
1.11
86496338--86496396
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1.9
31
96
0
109
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1.9
18
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0
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8
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2.0
29
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12
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86507314--86507341
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2.0
14
100
0
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22
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21
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15
0
12
1.12
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18
1.9
18
88
0
52
20
2
2
74
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373