Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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This is table  207  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70192551--70192627
27
2.8
27
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2
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25
15
28
29
1.96
70200562--70200739
27
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27
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3
205
26
15
28
29
1.96
70200563--70200718
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
70200559--70200739
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
70207721--70207898
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
70207722--70207877
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
70207718--70207898
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
70210770--70210835
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2.1
32
100
0
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2.0
164
100
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6.4
29
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4
189
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12
26
20
1.89
70217640--70217826
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3.2
58
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40
12
26
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1.89
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2.5
87
87
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22
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93
1.8
93
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29
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1.97
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29
19
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1.97
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44
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21
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28
20
22
1.98
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167
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1.97
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1.8
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90
0
277
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30
2.0
30
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25
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20
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10
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38
0
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50
4.5
50
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15
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1.96
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1.8
101
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0
237
26
16
26
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1.96
70231123--70231154
16
2.0
16
93
0
55
46
0
18
34
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70231478--70231814
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1.9
179
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1
496
38
8
18
34
1.82
70236070--70236242
93
1.9
93
88
2
267
22
20
28
28
1.98
70239227--70239261
15
2.3
15
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14
14
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1.53
70242017--70242189
93
1.9
93
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2
249
22
18
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31
1.97
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47
2.2
47
96
0
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27
30
7
34
1.85
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8.0
46
88
6
529
29
24
8
37
1.84
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96
3.8
96
92
0
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1.84
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144
2.5
144
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1.84
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100
0
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100
0
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0
0
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2.0
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0
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2.1
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7
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23
25
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4.6
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237
24
25
23
26
2.00
70293286--70293470
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2.3
80
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5
239
24
25
23
26
2.00
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24
2.2
24
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0
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22
16
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2.0
258
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20
26
27
1.99
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40
4.6
40
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2
242
27
23
27
21
1.99
70307633--70307723
3
30.3
3
73
20
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29
3
1
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1.15
70307637--70307723
27
3.4
27
71
19
78
29
3
1
65
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70307633--70307727
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3
1
65
1.15
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5.2
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82
11
50
36
0
5
58
1.20
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16
2.2
16
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0
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37
0
2
60
1.12
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282
30
4
5
60
1.38
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6.7
40
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26
27
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25
1.99
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26
28
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24
1.99
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21
1.9
21
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0
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35
2
22
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1.68
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44
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1.95
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251
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20
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1.95
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438
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20
20
1.94
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191
38
20
21
20
1.94
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30
3
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1.20
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39
19
9
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70346655--70346967
107
2.9
107
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4
371
38
20
9
31
1.84
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3.0
26
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95
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18
15
26
1.91
70355939--70356089
42
3.5
43
72
10
139
28
15
23
32
1.95
70355939--70356108
43
4.0
44
70
15
122
27
15
24
32
1.96
70355944--70356100
86
1.8
86
82
11
207
27
16
24
31
1.96
70358183--70358235
26
2.0
26
100
0
106
30
26
22
20
1.98
70359947--70359989
22
2.0
22
90
0
68
25
16
23
34
1.95
70364581--70364610
15
2.0
15
100
0
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6
6
53
1.53
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13
4.1
12
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11
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40
0
3
55
1.18
70369363--70369393
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0
3
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1.09
70374995--70375211
50
4.3
50
77
4
195
33
26
14
25
1.94
70375022--70375215
100
1.9
101
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2
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15
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1.96
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44
2.8
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11
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19
20
1.96
70390146--70390263
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2.8
42
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0
110
32
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23
27
1.96
70395822--70395891
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2.0
35
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0
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37
1.80
70398615--70398735
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2.6
46
79
12
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28
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29
22
1.98
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49
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7
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29
19
26
25
1.98
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29
2.0
29
100
0
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10
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70400502--70400550
15
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15
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25
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70400510--70400565
16
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22
57
44
10
8
35
1.71
70401593--70401646
27
2.0
27
92
0
90
31
27
16
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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23
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13
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33
26
6
33
1.83
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39
7.7
39
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1
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28
28
23
19
1.98
70417037--70417336
79
3.8
78
87
1
404
28
28
23
19
1.98
70417037--70417336
118
2.6
118
88
1
433
28
28
23
19
1.98
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27
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26
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20
18
25
1.95
70422355--70422423
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2.6
27
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1.80
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2.2
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80
2
200
43
19
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1.77
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27
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1.79
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1.99
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22
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21
26
21
30
1.98
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2.1
22
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1.80
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33
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19
1.96
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3.1
27
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0
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33
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1.97
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2.0
30
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70473456--70473558
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2.2
47
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1.91
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4.8
40
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1
298
24
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1.99
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2.5
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22
23
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27
2.00
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26
12
33
26
1.93
70542842--70543019
40
4.5
39
85
4
198
26
20
27
25
1.99
70542848--70543019
80
2.2
79
85
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229
25
21
27
25
1.99
70542875--70543052
79
2.2
80
82
3
200
25
21
28
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70549164--70549216
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2.0
26
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7
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45
3
0
50
1.19
70549164--70549206
14
3.1
14
75
24
54
44
4
0
51
1.22
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2.7
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3
50
1.33
70549303--70549352
26
2.0
26
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52
6
0
42
1.26
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2.1
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70549508--70549569
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29
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1.9
21
84
0
53
30
10
25
35
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373