Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.1
30
85
8
85
23
4
3
68
1.24
8968264--8968300
9
3.5
11
82
17
51
13
5
8
72
1.24
8968264--8968306
20
2.2
19
88
12
61
13
4
6
74
1.19
8968296--8968343
19
2.4
20
75
10
53
25
2
6
66
1.26
8968345--8968399
27
2.0
28
83
13
71
27
0
3
69
1.05
8968631--8968679
22
2.3
21
86
6
71
55
8
12
24
1.64
8970502--8970566
25
2.7
23
74
19
62
41
0
4
53
1.21
8983116--8983158
3
14.0
3
80
4
50
0
32
0
67
0.91
8983115--8983160
22
2.1
22
87
0
65
0
34
0
65
0.93
8984246--8984272
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
8986258--8986498
95
2.5
97
83
7
303
39
1
18
40
1.58
8986543--8987068
126
4.2
126
91
0
802
34
17
21
27
1.95
8989455--8989496
20
2.1
20
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0
57
19
16
16
47
1.83
8989575--8989606
16
2.0
16
93
0
55
71
0
6
21
1.07
8989635--8989686
11
4.9
11
79
9
63
42
0
26
30
1.56
8989635--8989685
20
2.5
20
87
6
66
41
0
27
31
1.56
8989635--8989698
31
2.1
31
82
5
76
42
0
25
32
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8992843--8992978
39
3.6
38
85
6
177
30
3
21
44
1.69
8994597--8994656
10
6.0
10
79
11
61
23
6
3
66
1.30
8996093--8996141
19
2.5
20
86
3
64
48
2
0
48
1.12
8997680--8997710
16
1.9
16
100
0
62
70
12
9
6
1.31
8999890--8999953
25
2.5
25
82
5
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23
21
26
28
1.99
9005196--9005250
21
2.6
21
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0
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23
23
14
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1.92
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42
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2
135
21
18
18
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1.90
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11
5.0
11
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30
20
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1.91
9006953--9007001
21
2.3
21
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0
89
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18
10
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1.85
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27
6.9
27
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0
282
25
20
17
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1.95
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27
6.8
27
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3
217
30
8
21
39
1.83
9007154--9007366
54
3.9
53
86
2
221
26
19
18
36
1.94
9007332--9007512
54
3.4
54
80
4
240
29
8
21
40
1.82
9007306--9007455
81
1.9
80
80
6
178
28
8
21
41
1.82
9007332--9007487
80
1.9
81
85
1
215
30
7
21
40
1.81
9007330--9007524
107
1.8
108
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313
30
7
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39
1.82
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107
2.2
107
83
7
287
30
8
21
39
1.83
9013862--9013898
18
2.1
18
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0
65
29
21
16
32
1.95
9017455--9017488
8
4.2
8
88
0
50
52
11
0
35
1.38
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21
2.2
22
82
10
55
31
16
18
33
1.94
9029332--9029366
16
2.2
16
94
0
61
34
0
8
57
1.29
9029756--9029828
37
2.0
36
94
2
128
50
6
2
39
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9032387--9032463
36
2.1
36
90
4
120
33
15
20
29
1.94
9033048--9033124
36
2.1
36
88
4
111
33
14
20
31
1.93
9032178--9035493
660
5.0
660
96
0
5933
27
14
21
36
1.93
9033708--9033784
36
2.1
36
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4
111
33
14
20
31
1.93
9034368--9034444
36
2.1
36
88
4
111
32
14
22
31
1.93
9034639--9034998
180
2.0
176
85
7
478
25
14
20
39
1.91
9035560--9035677
36
3.4
35
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10
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11
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20
73
7
110
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18
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3
172
18
18
16
46
1.84
9039449--9039597
63
2.4
62
81
4
163
18
18
16
46
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373