Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  271  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
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Score
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18
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Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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55
3
0
40
1.18
92164726--92164779
26
2.1
26
86
6
74
61
3
0
35
1.14
92164773--92164842
34
2.1
33
84
7
88
54
1
0
44
1.09
92164962--92165003
21
2.0
20
90
4
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38
0
0
61
0.96
92173824--92173860
18
2.1
18
89
0
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54
13
8
24
1.66
92173896--92173939
19
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21
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25
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0
34
1.56
92175968--92176018
18
2.7
18
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1
23
19
1.54
92178832--92178901
18
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19
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19
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0
12
47
1.42
92178836--92178917
39
2.1
39
97
0
155
39
0
12
48
1.41
92178850--92178917
21
3.4
21
73
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81
39
0
10
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1.37
92179779--92179818
19
2.1
19
100
0
80
37
10
10
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1.72
92182749--92182839
44
2.1
44
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0
146
30
13
7
48
1.70
92184413--92184558
43
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5
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19
17
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31
1.95
92184405--92184515
43
2.6
43
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4
136
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18
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1.95
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0
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1.96
92189062--92189109
17
2.8
16
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0
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92190098--92190143
13
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0
10
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0.83
92190185--92190217
17
1.9
17
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0
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12
30
54
3
1.52
92190476--92190531
23
2.4
23
79
8
60
35
5
5
53
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92200607--92200778
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2.5
69
84
4
215
28
14
23
33
1.94
92200778--92200943
72
2.3
71
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244
22
15
21
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1.89
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137
4.4
139
96
2
1132
24
17
21
36
1.94
92201622--92201774
72
2.1
71
84
4
200
29
16
22
30
1.96
92201622--92201802
72
2.5
72
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9
199
27
18
22
32
1.97
92212648--92212762
30
3.8
30
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2
144
27
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4
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1.68
92213353--92213496
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25
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2
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1.41
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8
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30
1
1
65
1.14
92213643--92213690
16
3.1
15
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69
31
2
2
64
1.16
92223510--92223678
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2.4
69
87
3
223
27
13
23
34
1.93
92223684--92223849
72
2.3
71
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4
217
22
13
19
43
1.87
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140
4.5
140
96
1
1132
25
16
20
37
1.93
92224107--92224140
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
92224436--92224531
49
2.0
49
97
0
183
30
16
20
32
1.95
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77
12.2
75
74
14
678
29
16
19
34
1.94
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1.8
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220
26
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19
33
1.96
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223
4.3
236
81
9
1036
28
16
20
34
1.95
92224612--92225639
486
2.1
469
84
7
1304
28
16
20
34
1.95
92226629--92226669
13
3.1
13
82
6
55
0
9
7
82
0.83
92226871--92226915
24
1.9
23
90
4
72
40
6
2
51
1.41
92226832--92226908
39
2.0
39
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102
32
6
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1.47
92227856--92227901
21
2.2
21
96
0
83
17
28
19
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92228102--92228132
14
2.2
14
94
0
53
12
6
16
64
1.47
92229391--92229480
44
2.1
43
91
6
146
30
11
12
46
1.76
92229532--92229581
22
2.2
22
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3
82
36
24
8
32
1.84
92233954--92233980
14
1.9
14
100
0
54
44
0
18
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1.50
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2.0
41
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0
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25
1.80
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245
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34
1.80
92245424--92245478
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3.0
18
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0
1
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1
1
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1.12
92245491--92245538
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2.4
20
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0
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70
2
2
25
1.09
92245660--92245773
10
11.9
10
67
16
55
30
2
2
64
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373