Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  275  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
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2.00
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Number
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1.10
93370258--93370327
12
5.8
12
77
19
74
61
1
0
37
1.05
93370199--93370342
21
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19
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22
96
59
0
0
38
1.07
93375830--93375908
11
7.4
10
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2
3
31
1.27
93375835--93376016
9
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9
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15
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28
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19
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20
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93376348--93376505
10
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2
63
1.23
93378126--93378179
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27
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1.80
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19
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2
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19
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0
35
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18
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3
0
42
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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4
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0
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24
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21
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1.94
93456047--93456198
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27
13
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1.94
93463987--93464138
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2.8
55
92
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27
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29
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2.2
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0
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127
2.0
128
98
1
508
29
29
9
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93466113--93466259
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29
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0
17
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112
46
19
10
23
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373