Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
5
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1.79
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2.6
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1
789
39
26
5
28
1.79
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3.6
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80
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0
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20
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0
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15
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4.2
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452984--453277
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309
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18
2.3
19
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12
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38
0
2
59
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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200
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2.3
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80
10
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32
5
11
50
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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138
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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26
11
17
44
1.83
576155--576187
2
16.5
2
100
0
66
51
48
0
0
1.00
579605--579653
21
2.3
21
82
6
64
51
8
6
34
1.57
579961--580003
22
2.0
22
85
0
59
20
13
9
55
1.66
589415--589444
15
2.0
15
100
0
60
46
13
20
20
1.83
600469--600511
22
1.9
23
85
4
61
23
0
27
48
1.51
613580--613743
77
2.1
77
90
0
256
22
5
25
46
1.73
625148--625180
15
2.3
14
94
5
57
36
0
0
63
0.95
626454--626521
29
2.3
29
85
10
84
27
5
11
54
1.60
629645--629780
70
1.9
70
96
0
254
38
16
17
26
1.91
632861--632899
20
2.0
20
94
0
69
35
7
12
43
1.72
637890--638280
195
2.0
195
92
2
660
28
5
19
46
1.73
638085--638476
217
1.8
218
92
1
671
29
5
20
44
1.74
649320--650070
163
4.5
165
75
10
554
30
16
13
39
1.87
649547--649930
162
2.3
166
82
9
444
28
15
14
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
653910--653954
22
2.0
23
86
4
65
53
0
2
44
1.13
659913--659985
37
1.9
38
91
2
121
36
1
4
57
1.26
660003--660087
41
2.1
41
100
0
170
49
14
4
31
1.63
670590--670627
19
2.1
18
85
14
51
34
0
7
57
1.28
671363--671399
11
3.5
11
85
10
51
64
0
0
35
0.94
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59
2.2
59
87
1
177
38
11
10
38
1.77
683647--683929
50
5.5
50
86
6
388
35
16
21
26
1.95
683907--684053
31
4.7
31
87
0
204
28
19
25
25
1.99
685191--685252
29
2.1
30
93
3
108
58
9
4
27
1.50
688612--688645
15
2.5
13
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9
50
41
2
0
55
1.15
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56
2.0
56
92
0
188
34
8
17
38
1.82
697667--697701
17
2.1
17
89
5
54
48
8
0
42
1.33
700766--700926
52
3.2
49
77
12
150
26
15
26
32
1.96
703323--703348
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
703747--703825
31
2.6
31
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6
81
26
15
8
49
1.73
705545--705705
84
1.9
85
87
7
238
31
29
8
30
1.87
707903--707927
7
3.6
7
100
0
50
12
0
0
88
0.53
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21
2.4
22
80
10
59
58
2
2
38
1.21
712612--712666
29
1.9
29
82
10
69
32
0
5
61
1.19
716501--716709
115
1.8
115
95
0
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31
23
11
33
1.91
720958--720985
2
14.0
2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
722500--722574
21
3.2
24
62
27
61
33
14
10
41
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
722501--722593
46
2.0
46
100
0
186
32
15
10
41
1.81
722652--722689
20
2.0
20
89
5
60
21
5
0
73
1.02
723762--723829
31
2.2
31
97
2
129
36
8
20
33
1.84
725180--725265
30
2.9
30
73
11
79
45
0
3
51
1.18
725176--725272
34
2.9
32
76
16
83
47
0
3
49
1.17
729574--730327
120
6.3
120
95
1
1235
44
2
4
48
1.36
729911--729945
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
730151--730185
18
2.0
17
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5
52
45
0
0
54
0.99
730271--730305
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2.0
17
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0
0
54
0.99
730470--730560
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          369   370   371   372   373