Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17936130--17936314
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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96
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.82
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1.03
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2.8
30
83
7
96
34
0
3
61
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18148329--18149086
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0
0
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80
16
78
40
0
0
59
0.97
18162849--18163087
121
2.0
121
91
0
388
29
23
22
24
1.99
18164208--18164320
43
2.7
43
78
1
129
36
27
14
22
1.92
18179147--18179199
21
2.5
21
100
0
106
26
32
28
13
1.93
18184864--18184907
14
3.0
14
80
6
52
47
0
6
45
1.29
18186507--18186574
34
2.1
31
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15
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30
8
17
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1.80
18188549--18189010
233
2.0
233
98
0
888
30
21
10
38
1.86
18193558--18193601
21
2.2
21
84
11
58
43
15
9
31
1.79
18205391--18205434
19
2.2
20
88
4
63
47
6
18
27
1.73
18218906--18218935
10
2.9
10
95
5
51
80
0
10
10
0.92
18218986--18219017
7
4.9
7
85
14
50
78
0
21
0
0.76
18218984--18219017
12
2.8
12
90
4
50
79
0
20
0
0.73
18232068--18232092
13
1.9
13
100
0
50
16
24
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20
1.91
18236166--18236293
55
2.3
54
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7
132
24
29
29
16
1.96
18246560--18246642
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40
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0
139
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19
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1.95
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18
2.1
18
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0
65
24
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27
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18261326--18261388
31
2.0
31
100
0
126
44
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19
26
1.81
18263108--18263137
13
2.3
13
94
0
51
50
6
13
30
1.67
18264697--18264731
18
2.0
18
94
5
63
42
0
0
57
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18264704--18264749
18
2.8
17
83
9
51
45
0
0
54
0.99
18264716--18264772
26
2.2
25
81
3
69
40
0
3
56
1.17
18264817--18264981
22
8.0
21
67
20
82
41
1
2
54
1.21
18264819--18264853
17
2.1
17
100
0
70
34
0
0
65
0.93
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120
2.6
120
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2
528
41
1
4
52
1.33
18264844--18264901
13
4.3
13
79
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41
1
0
56
1.09
18264765--18264956
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3.2
58
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18
162
42
1
3
53
1.26
18265107--18265197
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2.0
44
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2
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30
1.80
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16
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16
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0
108
28
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18
2.0
18
89
10
56
50
0
2
47
1.15
18266719--18266759
18
2.4
17
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18
50
48
0
2
48
1.14
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1.9
23
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8
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17
8
13
60
1.56
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12
2.1
12
100
0
50
24
8
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36
1.84
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42
2.2
42
88
3
132
52
10
5
31
1.59
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1.9
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462
30
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18279835--18279869
17
2.1
17
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0
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60
14
0
25
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2.2
18
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4
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42
15
2
40
1.60
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2.1
42
95
0
160
51
13
5
29
1.63
18285465--18285574
42
2.6
42
85
7
107
51
12
5
30
1.62
18285577--18285616
19
2.2
18
95
4
71
42
15
2
40
1.60
18291239--18291278
19
2.2
18
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42
15
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1.60
18295778--18295868
42
2.2
42
93
0
155
52
9
5
31
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18295781--18295890
42
2.6
42
84
7
98
52
9
4
33
1.53
18300250--18300431
97
1.9
97
94
0
319
36
15
10
37
1.82
18304037--18304074
18
2.1
19
90
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60
52
5
21
21
1.66
18312088--18312191
34
3.1
34
97
0
190
20
26
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18313502--18313562
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2.0
30
100
0
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29
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18
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18314247--18314609
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2.0
186
86
0
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10.7
3
100
0
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31
0
0
68
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373