Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  352  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116994491--116995119
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
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2.2
28
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40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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18
50
1.67
117119073--117119102
14
2.1
14
100
0
60
26
13
6
53
1.64
117121719--117122017
17
16.6
17
70
24
161
43
11
1
42
1.51
117121736--117121899
40
3.7
40
73
24
157
43
10
1
43
1.50
117121710--117121859
57
2.6
57
95
2
266
44
11
1
42
1.48
117121739--117122050
97
3.2
97
93
4
518
42
10
2
44
1.52
117121836--117121960
57
2.1
60
92
5
211
44
12
1
42
1.51
117121731--117122033
101
3.0
100
93
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533
42
10
1
44
1.50
117121885--117122000
44
2.7
43
90
5
184
43
11
1
43
1.50
117121929--117122050
57
2.1
57
92
0
199
41
10
2
45
1.52
117122022--117122092
13
5.5
13
86
0
106
39
7
2
50
1.44
117122022--117122093
26
2.8
26
100
0
144
40
6
2
50
1.44
117122242--117122389
74
2.0
74
100
0
296
51
1
6
40
1.37
117122429--117122655
19
12.5
19
68
23
100
46
19
0
32
1.56
117122444--117122565
18
6.4
18
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25
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18
1
35
1.60
117122425--117122830
26
16.1
26
87
7
579
46
20
0
32
1.56
117122602--117122732
19
7.5
19
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26
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48
20
0
30
1.55
117122549--117122830
77
3.7
76
95
1
492
47
20
0
31
1.54
117122822--117122875
9
5.7
10
79
20
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42
20
0
37
1.52
117122796--117122861
18
3.6
18
84
10
89
46
18
0
34
1.49
117122711--117122875
18
9.5
18
66
30
69
45
20
0
33
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117128325--117128395
21
3.4
21
80
0
79
33
18
45
2
1.64
117128619--117128652
14
2.4
14
95
0
59
17
8
20
52
1.71
117128718--117129049
42
7.9
42
87
1
189
28
20
20
30
1.98
117128807--117129093
42
6.8
42
91
2
434
23
21
21
33
1.98
117128720--117129093
84
4.5
82
84
4
433
27
20
20
31
1.98
117130078--117130190
41
2.7
42
87
5
158
28
25
15
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1.95
117130078--117130204
42
3.0
42
84
2
139
29
25
14
30
1.95
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49
2.2
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140
33
27
14
25
1.94
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2.0
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100
0
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1.89
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4.8
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0
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28
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26
1.98
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17
34
1.95
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0
0
50
1.00
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2.3
26
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2
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1
3
48
1.28
117135906--117136040
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2.0
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1
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2
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1.56
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33
2.1
33
85
0
91
52
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1
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1.38
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0
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0
0
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10
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37
5
22
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30
1.70
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0
61
28
0
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1.51
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17
1.9
17
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0
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0
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1.27
117175938--117175970
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0
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0
6
1.27
117180518--117180589
36
2.0
36
91
0
117
25
2
29
43
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117188027--117188059
11
3.1
11
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8
50
69
9
0
21
1.15
117188030--117188068
10
3.8
10
89
3
51
64
7
0
28
1.21
117188692--117188749
23
2.5
23
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5
91
48
18
3
29
1.65
117192021--117192074
28
2.0
28
82
10
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37
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1.9
187
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0
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5
7
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0
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37
4.0
37
91
1
233
24
22
16
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373